More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0473 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 254 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  94.49 
 
 		 254 aa  484  1e-136  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  62.85 
 
 		 255 aa  328  7e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  64.68 
 
 		 252 aa  323  2e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  57.71 
 
 		 254 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  56.75 
 
 		 251 aa  298  8e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  47.53 
 
 		 263 aa  223  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  48.44 
 
 		 257 aa  223  2e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  42.53 
 
 		 263 aa  206  3e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0170  dihydrodipicolinate reductase  44.24 
 
 		 270 aa  199  3e-50  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1732  dihydrodipicolinate reductase  44.24 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.329019  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0216  dihydrodipicolinate reductase  42.38 
 
 		 270 aa  192  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0730  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14973  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  38.52 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3170  dihydrodipicolinate reductase  40.08 
 
 		 252 aa  178  7e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.275412 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 268 aa  178  7e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0670  dihydrodipicolinate reductase  39.49 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0668  dihydrodipicolinate reductase  41.9 
 
 		 263 aa  176  3e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.314853  decreased coverage  0.00503816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  40.89 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  40.6 
 
 		 265 aa  171  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  39.55 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  41.13 
 
 		 266 aa  170  3e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  38.58 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  38.81 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  39.62 
 
 		 270 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  39.62 
 
 		 270 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 		 270 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  39.62 
 
 		 270 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  39.41 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  39.41 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  39.62 
 
 		 270 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  39.55 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  38.52 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 268 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  37.92 
 
 		 267 aa  165  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  38.58 
 
 		 270 aa  166  5e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  38.49 
 
 		 270 aa  165  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  37.45 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  36.57 
 
 		 271 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 268 aa  165  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  39.7 
 
 		 265 aa  164  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  38.29 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  38.38 
 
 		 271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  39.03 
 
 		 271 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  39.1 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  39.15 
 
 		 246 aa  163  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  39.85 
 
 		 244 aa  164  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  38.52 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  38.1 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 		 271 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  36.8 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  38.38 
 
 		 267 aa  161  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  37.41 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  37.41 
 
 		 267 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  37.08 
 
 		 269 aa  161  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  39.18 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  40.45 
 
 		 268 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  36.55 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  38.46 
 
 		 269 aa  160  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  37.92 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  37.41 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  38.35 
 
 		 266 aa  159  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  37.45 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  37.97 
 
 		 276 aa  159  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  36.43 
 
 		 274 aa  159  5e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  38.15 
 
 		 271 aa  159  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  39.1 
 
 		 265 aa  158  7e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  36.06 
 
 		 267 aa  158  9e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  39.11 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  36.43 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  36.33 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  37.45 
 
 		 276 aa  156  3e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  37.78 
 
 		 268 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 		 275 aa  155  4e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  38.35 
 
 		 265 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  38.72 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  38.58 
 
 		 265 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 		 265 aa  154  9e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  37.41 
 
 		 268 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0793  dihydrodipicolinate reductase  37.7 
 
 		 255 aa  154  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  38.06 
 
 		 267 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0803  dihydrodipicolinate reductase  40.93 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.737849  normal  0.659489 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  36.8 
 
 		 278 aa  153  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  37.21 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  37.17 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  39.62 
 
 		 273 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>