More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_0793 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0793  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
255 aa  501  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2743  dihydrodipicolinate reductase  78.46 
 
 
267 aa  379  1e-104  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.939063  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  62.15 
 
 
252 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0668  dihydrodipicolinate reductase  61.66 
 
 
263 aa  276  3e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.314853  decreased coverage  0.00503816 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3170  dihydrodipicolinate reductase  51.6 
 
 
252 aa  235  4e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.275412 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  36.65 
 
 
255 aa  171  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  37.02 
 
 
263 aa  169  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  38.25 
 
 
251 aa  170  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  39.37 
 
 
252 aa  168  7e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  36.02 
 
 
263 aa  167  1e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  38.49 
 
 
257 aa  167  1e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  38.49 
 
 
254 aa  165  6.9999999999999995e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  37.36 
 
 
276 aa  164  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  36.58 
 
 
262 aa  162  5.0000000000000005e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  37.55 
 
 
259 aa  161  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  36.57 
 
 
278 aa  161  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 
254 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  37.7 
 
 
254 aa  158  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0730  dihydrodipicolinate reductase  37.59 
 
 
270 aa  157  1e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14973  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0170  dihydrodipicolinate reductase  37.22 
 
 
270 aa  157  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  38.64 
 
 
266 aa  157  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0096  dihydrodipicolinate reductase  41.85 
 
 
260 aa  156  3e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  37.45 
 
 
268 aa  155  4e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  34.6 
 
 
269 aa  156  4e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  36.26 
 
 
261 aa  155  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0216  dihydrodipicolinate reductase  36.09 
 
 
270 aa  154  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  38.4 
 
 
267 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  38.11 
 
 
274 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3278  dihydrodipicolinate reductase  38.11 
 
 
267 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.421535  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  37.69 
 
 
273 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  38.64 
 
 
269 aa  154  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 
267 aa  154  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  36.26 
 
 
263 aa  153  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  37.69 
 
 
273 aa  152  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  40.53 
 
 
265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  40.94 
 
 
267 aa  152  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  35.88 
 
 
263 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  35.34 
 
 
268 aa  152  4e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  39.47 
 
 
267 aa  152  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  36.74 
 
 
267 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 
270 aa  152  5e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  38.02 
 
 
267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0670  dihydrodipicolinate reductase  36.57 
 
 
273 aa  152  7e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1732  dihydrodipicolinate reductase  36.84 
 
 
270 aa  152  7e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.329019  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  37.55 
 
 
264 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  39.62 
 
 
268 aa  151  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  36.47 
 
 
267 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 
276 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  37.74 
 
 
271 aa  151  1e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  37.64 
 
 
267 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  36.74 
 
 
267 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  36.98 
 
 
273 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  32.69 
 
 
251 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  37.88 
 
 
256 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  36.74 
 
 
267 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  37.22 
 
 
273 aa  149  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  34.2 
 
 
271 aa  149  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 
271 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  35.19 
 
 
271 aa  149  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1898  dihydrodipicolinate reductase  39.47 
 
 
267 aa  149  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301098  normal  0.262689 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  37.12 
 
 
256 aa  149  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  37.22 
 
 
273 aa  148  8e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  35.96 
 
 
271 aa  148  9e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  37.97 
 
 
269 aa  148  9e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 
273 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  37.36 
 
 
266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 
267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  34.66 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  37.78 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  36.3 
 
 
268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  36.84 
 
 
282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  40.23 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  35.82 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  35.82 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  37.64 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  35.58 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 
273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  36.26 
 
 
263 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 
268 aa  146  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 
273 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  36.98 
 
 
270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  37.12 
 
 
273 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  37.88 
 
 
267 aa  145  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  35.09 
 
 
273 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  35.45 
 
 
273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  35.97 
 
 
254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  37.82 
 
 
300 aa  145  8.000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  36.15 
 
 
259 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  36.88 
 
 
269 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  36.09 
 
 
278 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  32.85 
 
 
268 aa  144  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2977  dihydrodipicolinate reductase  38.07 
 
 
241 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  35.85 
 
 
267 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  35.85 
 
 
271 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  35.71 
 
 
267 aa  143  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  37.17 
 
 
269 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  37.45 
 
 
268 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  36.3 
 
 
269 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>