More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3190 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
244 aa  485  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  53.53 
 
 
246 aa  244  8e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  42.48 
 
 
266 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 
268 aa  212  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  42.98 
 
 
267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  40.98 
 
 
266 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  45.11 
 
 
270 aa  211  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  44.24 
 
 
268 aa  211  1e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  46.79 
 
 
267 aa  210  2e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  43.66 
 
 
268 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  43.66 
 
 
268 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  43.66 
 
 
268 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 
265 aa  209  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  43.66 
 
 
268 aa  209  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  46.24 
 
 
268 aa  209  3e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  43.66 
 
 
268 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  43.66 
 
 
268 aa  208  6e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  46.04 
 
 
265 aa  208  7e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 
271 aa  208  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  45.32 
 
 
268 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  44.24 
 
 
268 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 
265 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 
265 aa  207  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  45.28 
 
 
267 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  45.28 
 
 
265 aa  206  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1729  dihydrodipicolinate reductase  47.21 
 
 
268 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  45.28 
 
 
265 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  45.32 
 
 
268 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  43.02 
 
 
271 aa  206  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  43.61 
 
 
274 aa  206  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  47.73 
 
 
268 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  44.91 
 
 
269 aa  206  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  45.53 
 
 
265 aa  205  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  45.31 
 
 
265 aa  205  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  43.12 
 
 
270 aa  205  6e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  43.02 
 
 
270 aa  204  7e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  43.77 
 
 
267 aa  204  9e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  40.98 
 
 
267 aa  204  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  43.98 
 
 
266 aa  204  1e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  46.36 
 
 
264 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  42.8 
 
 
271 aa  204  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  43.98 
 
 
269 aa  203  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  44.74 
 
 
267 aa  203  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 
270 aa  202  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  39.78 
 
 
267 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 
270 aa  202  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  44.53 
 
 
265 aa  202  4e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  46.62 
 
 
269 aa  202  4e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 
267 aa  202  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  44.36 
 
 
267 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 
270 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 
270 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 
270 aa  202  5e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 
270 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 
270 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  44.4 
 
 
268 aa  202  6e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  39.78 
 
 
267 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  48.58 
 
 
270 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  42.48 
 
 
269 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 
266 aa  200  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 
270 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 
270 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  48.58 
 
 
270 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  42.48 
 
 
271 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  43.77 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  44.36 
 
 
267 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  44.36 
 
 
284 aa  197  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  43.98 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  46.07 
 
 
267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  48.58 
 
 
270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  43.98 
 
 
267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  41.51 
 
 
265 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  43.77 
 
 
267 aa  195  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  42.11 
 
 
268 aa  195  5.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  43.61 
 
 
267 aa  195  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  47.58 
 
 
265 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  43.56 
 
 
263 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  42.38 
 
 
269 aa  194  1e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  42.64 
 
 
265 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  43.56 
 
 
263 aa  194  1e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  43.23 
 
 
278 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  41.89 
 
 
271 aa  193  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  41.57 
 
 
267 aa  192  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  42.64 
 
 
275 aa  192  5e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  44.44 
 
 
267 aa  192  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  49.04 
 
 
254 aa  191  8e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  43.03 
 
 
278 aa  191  1e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  44.7 
 
 
300 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  44.15 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  42.05 
 
 
282 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  41.82 
 
 
276 aa  189  2.9999999999999997e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3383  dihydrodipicolinate reductase  46.45 
 
 
254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000141563 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  47.64 
 
 
267 aa  188  5.999999999999999e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 
242 aa  188  7e-47  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  42.05 
 
 
263 aa  188  8e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  45.7 
 
 
251 aa  187  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  40.89 
 
 
273 aa  187  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  40.89 
 
 
273 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>