More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0516 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0516  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 238 aa  484  1e-136  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401323 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28160  dihydrodipicolinate reductase  52.52 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.012111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  38.03 
 
 		 242 aa  157  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  41.15 
 
 		 268 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  39.23 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0298  dihydrodipicolinate reductase  41.18 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.521005  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2977  dihydrodipicolinate reductase  34.58 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  46.11 
 
 		 252 aa  148  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  42.71 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1763  dihydrodipicolinate reductase  34.63 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  42.16 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  38.17 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1810  dihydrodipicolinate reductase  44.21 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.109637 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1272  dihydrodipicolinate reductase  36.97 
 
 		 216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000793767  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  34.32 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  37.55 
 
 		 252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1414  dihydrodipicolinate reductase  36.55 
 
 		 216 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0054819  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  38.11 
 
 		 254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0966  dihydrodipicolinate reductase  36.33 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  36.25 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  36.89 
 
 		 255 aa  145  6e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1486  dihydrodipicolinate reductase  36.78 
 
 		 240 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1457  dihydrodipicolinate reductase  36.78 
 
 		 240 aa  145  7.0000000000000006e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46202  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3170  dihydrodipicolinate reductase  42.42 
 
 		 252 aa  144  1e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.275412 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1005  dihydrodipicolinate reductase  34.18 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  42.27 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1358  dihydrodipicolinate reductase  35.92 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 		 246 aa  143  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  35.25 
 
 		 266 aa  142  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  38.01 
 
 		 267 aa  142  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 266 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0668  dihydrodipicolinate reductase  43.96 
 
 		 263 aa  142  6e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.314853  decreased coverage  0.00503816 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  36.44 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  35.93 
 
 		 242 aa  141  7e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  35.93 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  37.37 
 
 		 252 aa  140  9.999999999999999e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  37.67 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  34.48 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  41.46 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  38.32 
 
 		 268 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  35.65 
 
 		 248 aa  138  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 		 267 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  36.29 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  39.02 
 
 		 269 aa  138  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  38.79 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  34.8 
 
 		 251 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  37.56 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  37.55 
 
 		 263 aa  135  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  35.71 
 
 		 254 aa  135  4e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  42 
 
 		 242 aa  135  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  38.97 
 
 		 255 aa  135  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  37.25 
 
 		 272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  36.89 
 
 		 269 aa  135  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  43.18 
 
 		 262 aa  135  8e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  40.85 
 
 		 267 aa  134  9e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  38.71 
 
 		 267 aa  134  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  37.85 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  37.85 
 
 		 267 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  37.86 
 
 		 278 aa  133  1.9999999999999998e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  37.85 
 
 		 269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  37.38 
 
 		 268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  38.54 
 
 		 269 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1223  dihydrodipicolinate reductase  30.08 
 
 		 212 aa  133  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 276 aa  133  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1971  dihydrodipicolinate reductase  36.4 
 
 		 256 aa  132  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.744905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  40.59 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  37.85 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  38.68 
 
 		 241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  37.55 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  37.38 
 
 		 267 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0793  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 		 267 aa  131  7.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  36.92 
 
 		 267 aa  131  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  34.35 
 
 		 269 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  35.22 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  37.56 
 
 		 267 aa  131  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  36.94 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  38.14 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  38.14 
 
 		 289 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00090  dihydrodipicolinate reductase  39.79 
 
 		 222 aa  129  3e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266189  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  37.55 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1055  dihydrodipicolinate reductase  37.24 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0450  dihydrodipicolinate reductase  37.7 
 
 		 237 aa  128  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  38.83 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  37.36 
 
 		 263 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  39.49 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  39.81 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0391  dihydrodipicolinate reductase  37.37 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4712  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  31.54 
 
 		 270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  31.68 
 
 		 267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1732  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.329019  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  40.39 
 
 		 271 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2997  dihydrodipicolinate reductase  34.44 
 
 		 274 aa  125  4.0000000000000003e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 267 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  34.9 
 
 		 264 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  39.13 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 269 aa  125  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0670  dihydrodipicolinate reductase  39.05 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>