More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0391 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0391  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
236 aa  470  1e-132  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4712  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0450  dihydrodipicolinate reductase  97.88 
 
 
237 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1810  dihydrodipicolinate reductase  71.67 
 
 
239 aa  332  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.109637 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00090  dihydrodipicolinate reductase  69.23 
 
 
222 aa  317  1e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266189  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  33.58 
 
 
267 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  38.17 
 
 
267 aa  152  5e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  36.9 
 
 
273 aa  151  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  39.3 
 
 
244 aa  150  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 
267 aa  150  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  39.76 
 
 
267 aa  149  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  34.19 
 
 
273 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  36.09 
 
 
267 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  36.47 
 
 
267 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 
273 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 
273 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  37.12 
 
 
268 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 
273 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 
273 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  31.75 
 
 
252 aa  145  5e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  36.26 
 
 
267 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 
273 aa  144  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  32.81 
 
 
252 aa  144  9e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  37.5 
 
 
278 aa  144  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  36.09 
 
 
271 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  36.55 
 
 
242 aa  144  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3278  dihydrodipicolinate reductase  36.92 
 
 
267 aa  144  1e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.421535  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  35.16 
 
 
269 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  34.19 
 
 
273 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  37.02 
 
 
268 aa  144  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  32.96 
 
 
269 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  36.26 
 
 
265 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  35.66 
 
 
273 aa  143  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  35.88 
 
 
267 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  32.16 
 
 
251 aa  143  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  34.35 
 
 
265 aa  142  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  38.04 
 
 
246 aa  143  3e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  35.66 
 
 
273 aa  143  3e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  35.88 
 
 
267 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  37.05 
 
 
255 aa  142  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  35.06 
 
 
273 aa  142  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  36.54 
 
 
256 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 
267 aa  142  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  35.66 
 
 
255 aa  142  5e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  34.48 
 
 
267 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  35.85 
 
 
267 aa  142  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  36.26 
 
 
265 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  34.69 
 
 
268 aa  142  6e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  38.22 
 
 
264 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 
271 aa  141  7e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 
269 aa  141  7e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  33.86 
 
 
255 aa  141  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  35.29 
 
 
273 aa  141  8e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  37.02 
 
 
267 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  35.88 
 
 
267 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  33.82 
 
 
273 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1898  dihydrodipicolinate reductase  39.55 
 
 
267 aa  140  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301098  normal  0.262689 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  35.63 
 
 
267 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  34.47 
 
 
266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 
268 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 
268 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 
268 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  34.96 
 
 
273 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  34.96 
 
 
273 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 
268 aa  139  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  34.96 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  34.96 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  35.11 
 
 
265 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  34.96 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0035  dihydrodipicolinate reductase  34.96 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  31.6 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00034  hypothetical protein  34.96 
 
 
273 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0706545  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0033  dihydrodipicolinate reductase  34.96 
 
 
273 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  33.95 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  34.96 
 
 
273 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  34.34 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  35.5 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  35.5 
 
 
265 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  33.95 
 
 
268 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  35.5 
 
 
265 aa  138  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  38.97 
 
 
268 aa  138  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  36.43 
 
 
263 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  36.43 
 
 
263 aa  138  7e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 
269 aa  138  7.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 
265 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  35.5 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  32.08 
 
 
268 aa  137  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  35.58 
 
 
263 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  32.95 
 
 
269 aa  136  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  35.32 
 
 
252 aa  136  2e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  34.35 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  33.09 
 
 
271 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  32.6 
 
 
270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  34.73 
 
 
265 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  35.45 
 
 
271 aa  135  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1358  dihydrodipicolinate reductase  34.13 
 
 
258 aa  135  5e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  36.92 
 
 
256 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 
284 aa  135  5e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 
300 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>