More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1133 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 252 aa  516  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  61.04 
 
 		 252 aa  313  1.9999999999999998e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  58.96 
 
 		 254 aa  306  2.0000000000000002e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  54.62 
 
 		 251 aa  279  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  55.6 
 
 		 251 aa  278  6e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1873  dihydrodipicolinate reductase  47.01 
 
 		 254 aa  249  4e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2162  dihydrodipicolinate reductase  46.61 
 
 		 254 aa  247  1e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.528738  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  37.74 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  38.46 
 
 		 264 aa  196  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 		 267 aa  194  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  35.09 
 
 		 267 aa  191  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 		 267 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2977  dihydrodipicolinate reductase  48.53 
 
 		 241 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0966  dihydrodipicolinate reductase  46.15 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  37.12 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  38.26 
 
 		 270 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  38.11 
 
 		 269 aa  188  8e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  41.79 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  37.74 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  38.11 
 
 		 271 aa  186  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  35.34 
 
 		 268 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  36.5 
 
 		 265 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  35.85 
 
 		 266 aa  185  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  37.5 
 
 		 273 aa  185  7e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  38.11 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  36.47 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  36.12 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  35.09 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  36.74 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  35.34 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  36.5 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  37.12 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1763  dihydrodipicolinate reductase  49.5 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  42.44 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  36.5 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  44.33 
 
 		 269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  36.12 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1005  dihydrodipicolinate reductase  46.08 
 
 		 238 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  36.12 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  36.5 
 
 		 263 aa  181  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  36.74 
 
 		 273 aa  181  9.000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 273 aa  181  9.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  36.74 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  43.37 
 
 		 278 aa  181  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  36.74 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  36.74 
 
 		 273 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  36.74 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  36.88 
 
 		 263 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  36.12 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  38.87 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  33.58 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 		 271 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 274 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 		 265 aa  178  7e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  36.5 
 
 		 263 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  34.09 
 
 		 270 aa  178  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  35.61 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  35.8 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  35.88 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 273 aa  177  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 268 aa  177  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 265 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  34.85 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  34.85 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 		 271 aa  176  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  34.09 
 
 		 276 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  34.85 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  34.85 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  37.64 
 
 		 270 aa  176  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1486  dihydrodipicolinate reductase  43.32 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  35.58 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  34.6 
 
 		 265 aa  176  3e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1457  dihydrodipicolinate reductase  43.32 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46202  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  35.23 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  35.23 
 
 		 270 aa  176  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0096  dihydrodipicolinate reductase  38.02 
 
 		 260 aa  175  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 273 aa  175  7e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  33.72 
 
 		 267 aa  175  7e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0035  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 273 aa  175  8e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  36.09 
 
 		 265 aa  175  8e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 273 aa  174  9e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 273 aa  174  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  36.12 
 
 		 268 aa  174  9e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  37.5 
 
 		 244 aa  174  9e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  35.61 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  38.34 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  35.45 
 
 		 272 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  34.85 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>