More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1414 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1414  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 216 aa  432  1e-120  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0054819  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1272  dihydrodipicolinate reductase  96.3 
 
 		 216 aa  422  1e-117  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000793767  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  51.89 
 
 		 217 aa  248  4e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0073  dihydrodipicolinate reductase  54.72 
 
 		 215 aa  238  4e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1223  dihydrodipicolinate reductase  51.89 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1810  dihydrodipicolinate reductase  39.48 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.109637 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1873  dihydrodipicolinate reductase  37.86 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  33.46 
 
 		 275 aa  151  8.999999999999999e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  37.96 
 
 		 251 aa  150  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2162  dihydrodipicolinate reductase  38.27 
 
 		 254 aa  150  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.528738  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  34.41 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  33.84 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  33.84 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 		 266 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  36 
 
 		 257 aa  148  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  33.08 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  34.69 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  33.21 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 266 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  33.59 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  36.97 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  31.18 
 
 		 269 aa  146  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  38.98 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  33.08 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  33.59 
 
 		 267 aa  145  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0516  dihydrodipicolinate reductase  36.55 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401323 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  36.33 
 
 		 254 aa  145  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  35.95 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  36 
 
 		 254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  37.95 
 
 		 267 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  32.7 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  34.35 
 
 		 267 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  32.7 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  32.7 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  32.7 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  32.7 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  34.5 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  32.82 
 
 		 267 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  38.46 
 
 		 267 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  37.44 
 
 		 267 aa  144  1e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  32.06 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  31.7 
 
 		 267 aa  143  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  37.95 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  31.84 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  31.94 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  34.8 
 
 		 254 aa  141  7e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  38.46 
 
 		 268 aa  141  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  32.08 
 
 		 267 aa  141  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  31.68 
 
 		 267 aa  141  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  32.82 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  32.7 
 
 		 267 aa  140  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  31.18 
 
 		 270 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  31.56 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  36.82 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  33.06 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  35.9 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0204  dihydrodipicolinate reductase  36.59 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  35.38 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0966  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 240 aa  139  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  34.88 
 
 		 267 aa  139  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  29.66 
 
 		 273 aa  139  3e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  38.78 
 
 		 268 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  34.08 
 
 		 265 aa  138  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  31.3 
 
 		 268 aa  138  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  34.36 
 
 		 270 aa  138  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  34.36 
 
 		 270 aa  138  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  31.56 
 
 		 273 aa  138  7.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  31.56 
 
 		 273 aa  137  8.999999999999999e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  29.28 
 
 		 273 aa  137  8.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1457  dihydrodipicolinate reductase  35.39 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46202  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1486  dihydrodipicolinate reductase  35.39 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  35.44 
 
 		 248 aa  137  1e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  30.42 
 
 		 273 aa  137  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00090  dihydrodipicolinate reductase  40.78 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266189  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  37.44 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  34.31 
 
 		 242 aa  136  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  31.18 
 
 		 278 aa  136  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  30.8 
 
 		 276 aa  137  2e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  34.36 
 
 		 270 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  34.36 
 
 		 270 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  34.91 
 
 		 233 aa  135  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 264 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0035  dihydrodipicolinate reductase  32.32 
 
 		 273 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  30.04 
 
 		 273 aa  135  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  29.66 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  35.38 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  31.18 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  33.84 
 
 		 266 aa  135  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  30.19 
 
 		 274 aa  135  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  33.08 
 
 		 269 aa  135  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  34.22 
 
 		 265 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  33.85 
 
 		 270 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  33.85 
 
 		 270 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  33.85 
 
 		 270 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  33.85 
 
 		 270 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  34.31 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  33.21 
 
 		 265 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0668  dihydrodipicolinate reductase  34.25 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.314853  decreased coverage  0.00503816 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  31.94 
 
 		 273 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  31.94 
 
 		 273 aa  135  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>