More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1358 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1358  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 258 aa  534  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  62.99 
 
 		 254 aa  348  7e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0298  dihydrodipicolinate reductase  64.98 
 
 		 254 aa  341  5.999999999999999e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.521005  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  60.08 
 
 		 248 aa  319  3e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  60.47 
 
 		 242 aa  315  4e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  60.47 
 
 		 242 aa  315  7e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  58.27 
 
 		 256 aa  313  1.9999999999999998e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  58.89 
 
 		 242 aa  307  1.0000000000000001e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  58.04 
 
 		 255 aa  304  8.000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  56.86 
 
 		 255 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  39.41 
 
 		 268 aa  199  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  37.92 
 
 		 267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  37.55 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 		 275 aa  194  1e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  39.63 
 
 		 269 aa  194  1e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  37.55 
 
 		 267 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  37.08 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  38.66 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  36.47 
 
 		 270 aa  190  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  37.97 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  37.36 
 
 		 271 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  36.8 
 
 		 267 aa  189  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  37.45 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0974  dihydrodipicolinate reductase  37.97 
 
 		 270 aa  189  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000335304  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  37.22 
 
 		 267 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  37.83 
 
 		 267 aa  189  5.999999999999999e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  35.61 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  42.06 
 
 		 273 aa  187  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  37.74 
 
 		 268 aa  187  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  36.23 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  39.84 
 
 		 261 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  34.85 
 
 		 273 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  39.03 
 
 		 267 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  36.7 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  36.7 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  36.7 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  36.7 
 
 		 270 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  41.59 
 
 		 273 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  35.85 
 
 		 270 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  35.85 
 
 		 270 aa  186  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 		 270 aa  185  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  40.22 
 
 		 268 aa  185  8e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  34.85 
 
 		 273 aa  185  8e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  35.93 
 
 		 264 aa  184  8e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 		 268 aa  184  9e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  35.32 
 
 		 273 aa  184  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  38.95 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  35.69 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  34.57 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  41.12 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  35.82 
 
 		 276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  37.04 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  36.33 
 
 		 270 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  34.47 
 
 		 273 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  34.47 
 
 		 273 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  34.47 
 
 		 273 aa  182  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  41.9 
 
 		 268 aa  183  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2840  dihydrodipicolinate reductase  35.85 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000040359  normal  0.0597866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  35.09 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  36.84 
 
 		 267 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 		 270 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  34.83 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  37.08 
 
 		 267 aa  182  6e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  39.1 
 
 		 266 aa  181  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  36.33 
 
 		 266 aa  181  1e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  35.34 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  41.43 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 265 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  32.84 
 
 		 273 aa  179  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  35.32 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 265 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  43.33 
 
 		 266 aa  178  7e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  41.63 
 
 		 267 aa  178  7e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  35.61 
 
 		 265 aa  178  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  43.81 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  37.5 
 
 		 263 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  43.33 
 
 		 266 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  37.5 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  37.6 
 
 		 244 aa  176  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  40.46 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  38.58 
 
 		 267 aa  176  3e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 		 276 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  38.28 
 
 		 246 aa  176  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  37.12 
 
 		 265 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  35.23 
 
 		 269 aa  175  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0803  dihydrodipicolinate reductase  38.89 
 
 		 263 aa  175  7e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.737849  normal  0.659489 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  37.12 
 
 		 265 aa  174  8e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  34.19 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  35.21 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  34.09 
 
 		 273 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  34.59 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  36.06 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  37.41 
 
 		 271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  36.74 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  34.85 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  44 
 
 		 266 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>