More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_28160 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_28160  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 239 aa  487  1e-137  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.012111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0516  dihydrodipicolinate reductase  52.52 
 
 		 238 aa  238  5.999999999999999e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00401323 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  40.41 
 
 		 242 aa  168  9e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  40.5 
 
 		 242 aa  162  5.0000000000000005e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  40.5 
 
 		 242 aa  162  6e-39  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  37.15 
 
 		 252 aa  159  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  40.08 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  37.05 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  38.58 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1457  dihydrodipicolinate reductase  39.75 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46202  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1486  dihydrodipicolinate reductase  39.75 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1358  dihydrodipicolinate reductase  37.7 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1763  dihydrodipicolinate reductase  35.29 
 
 		 231 aa  154  1e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0966  dihydrodipicolinate reductase  38.11 
 
 		 240 aa  152  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  37.79 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  36.86 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  39.43 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0298  dihydrodipicolinate reductase  42.35 
 
 		 254 aa  149  4e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.521005  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  36.4 
 
 		 256 aa  148  8e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  36.9 
 
 		 254 aa  145  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  37.3 
 
 		 251 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  37.55 
 
 		 254 aa  144  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  40.98 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  36.33 
 
 		 254 aa  143  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2162  dihydrodipicolinate reductase  35.57 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.528738  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  36.51 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  37.05 
 
 		 252 aa  143  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1873  dihydrodipicolinate reductase  35.57 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  38.29 
 
 		 268 aa  141  8e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  40.28 
 
 		 242 aa  141  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0668  dihydrodipicolinate reductase  41.4 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.314853  decreased coverage  0.00503816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  34.13 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2977  dihydrodipicolinate reductase  34.65 
 
 		 241 aa  139  4.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1414  dihydrodipicolinate reductase  36.09 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0054819  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  34.92 
 
 		 254 aa  136  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1272  dihydrodipicolinate reductase  37.07 
 
 		 216 aa  136  4e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000793767  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 		 268 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  35.96 
 
 		 263 aa  135  8e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  34.75 
 
 		 257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  35.43 
 
 		 261 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1971  dihydrodipicolinate reductase  39.2 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.744905 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  40.09 
 
 		 267 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2439  dihydrodipicolinate reductase  37.88 
 
 		 264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0628599  normal  0.395118 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0793  dihydrodipicolinate reductase  37.1 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3170  dihydrodipicolinate reductase  34.96 
 
 		 252 aa  131  6.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.275412 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  36.48 
 
 		 241 aa  131  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  34.51 
 
 		 259 aa  131  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  35.95 
 
 		 256 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  33.73 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  36.9 
 
 		 276 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  36.87 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  44.64 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2743  dihydrodipicolinate reductase  36.33 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.939063  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  36.9 
 
 		 278 aa  129  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0803  dihydrodipicolinate reductase  33.2 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.737849  normal  0.659489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  40.09 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  36.41 
 
 		 267 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  33.46 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  35.83 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  37.93 
 
 		 271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  39.72 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00090  dihydrodipicolinate reductase  40.72 
 
 		 222 aa  126  3e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266189  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  34.98 
 
 		 263 aa  126  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  37.34 
 
 		 244 aa  126  3e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  36.92 
 
 		 268 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  38.79 
 
 		 268 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1525  dihydrodipicolinate reductase  31.91 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150492  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  39.09 
 
 		 268 aa  125  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  37.67 
 
 		 264 aa  125  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  36.97 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  36.97 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  36.97 
 
 		 267 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  37.44 
 
 		 268 aa  124  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  34.76 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  38.39 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  36.49 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1810  dihydrodipicolinate reductase  35.8 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.109637 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  37.74 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  35.91 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  37.74 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  37.74 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2997  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 		 274 aa  122  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  37.74 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  37.74 
 
 		 268 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  37.74 
 
 		 268 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  35.9 
 
 		 267 aa  122  4e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  37.74 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  35.68 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1223  dihydrodipicolinate reductase  30.13 
 
 		 212 aa  122  6e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  36.02 
 
 		 267 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1005  dihydrodipicolinate reductase  32.5 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  31.38 
 
 		 266 aa  122  7e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  35.07 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  36.11 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  37.56 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  33.98 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  33.19 
 
 		 270 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  38.27 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0216  dihydrodipicolinate reductase  34.69 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>