More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1873 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1873  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 254 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2162  dihydrodipicolinate reductase  98.43 
 
 		 254 aa  512  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.528738  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  49.6 
 
 		 254 aa  254  9e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  48.81 
 
 		 252 aa  249  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  47.01 
 
 		 252 aa  249  4e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  50.4 
 
 		 251 aa  245  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  44.05 
 
 		 251 aa  236  2e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2977  dihydrodipicolinate reductase  44.5 
 
 		 241 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1763  dihydrodipicolinate reductase  44.33 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  36.06 
 
 		 268 aa  176  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  36.67 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  36.3 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  36.43 
 
 		 267 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  35.45 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  35.45 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  43.72 
 
 		 266 aa  169  4e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  34.7 
 
 		 271 aa  169  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  35.96 
 
 		 269 aa  167  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  35.69 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  35.69 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  37.11 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  36.43 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  41.5 
 
 		 267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  35.07 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  38.7 
 
 		 256 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  38.66 
 
 		 266 aa  164  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  35.32 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  38.29 
 
 		 266 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  42.93 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  35.32 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  37.04 
 
 		 268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  34.83 
 
 		 276 aa  161  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  33.58 
 
 		 268 aa  161  8.000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  41.71 
 
 		 268 aa  161  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  36.06 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  36.9 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  35.94 
 
 		 251 aa  160  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  34.44 
 
 		 268 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1005  dihydrodipicolinate reductase  37.78 
 
 		 238 aa  161  1e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  36.06 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  37.92 
 
 		 267 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  37.17 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  35.58 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  34.72 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  35.07 
 
 		 263 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  40.5 
 
 		 268 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  37.98 
 
 		 255 aa  158  7e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 		 269 aa  158  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  34.7 
 
 		 263 aa  158  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0298  dihydrodipicolinate reductase  38.89 
 
 		 254 aa  158  9e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.521005  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  36.94 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  36.7 
 
 		 270 aa  157  1e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  36.94 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  33.7 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  34.2 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  34.59 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  35.77 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  35.25 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1457  dihydrodipicolinate reductase  39.76 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46202  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1486  dihydrodipicolinate reductase  39.76 
 
 		 240 aa  156  3e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1358  dihydrodipicolinate reductase  36.15 
 
 		 258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  37.6 
 
 		 254 aa  155  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  38.89 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  32.45 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0253  dihydrodipicolinate reductase  32.96 
 
 		 266 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  35.61 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  34.19 
 
 		 269 aa  153  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1732  dihydrodipicolinate reductase  36.5 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.329019  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  36.9 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  35.52 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  32.96 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0170  dihydrodipicolinate reductase  35.77 
 
 		 270 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  32.96 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  34.94 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  32.96 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  35.94 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  32.96 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  32.96 
 
 		 268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  34.08 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  33.08 
 
 		 263 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  36.76 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  35.94 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  32.96 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  32.96 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  33.71 
 
 		 268 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  41.06 
 
 		 265 aa  152  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  36.53 
 
 		 267 aa  152  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0670  dihydrodipicolinate reductase  35.77 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  32.96 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  35.58 
 
 		 267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1414  dihydrodipicolinate reductase  37.86 
 
 		 216 aa  152  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0054819  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  36.8 
 
 		 271 aa  151  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  34.08 
 
 		 266 aa  151  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  34.08 
 
 		 265 aa  151  8e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  33.82 
 
 		 267 aa  151  8.999999999999999e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>