More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00090 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00090  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 222 aa  443  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.266189  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1810  dihydrodipicolinate reductase  76.13 
 
 		 239 aa  334  5e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.109637 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0391  dihydrodipicolinate reductase  69.23 
 
 		 236 aa  302  2.0000000000000002e-81  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.4712  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0450  dihydrodipicolinate reductase  68.47 
 
 		 237 aa  301  4.0000000000000003e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  46.43 
 
 		 269 aa  165  5e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  44.44 
 
 		 273 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  45.41 
 
 		 273 aa  160  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  43.37 
 
 		 269 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  43.37 
 
 		 269 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  47.21 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  44.67 
 
 		 267 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  43.94 
 
 		 273 aa  157  8e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  43.43 
 
 		 273 aa  157  9e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  43.43 
 
 		 273 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  44.17 
 
 		 267 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  44.33 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  43.88 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  44.44 
 
 		 273 aa  155  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  43.43 
 
 		 273 aa  155  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  44.44 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  35.27 
 
 		 252 aa  154  9e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  43.94 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 		 268 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0035  dihydrodipicolinate reductase  46.43 
 
 		 273 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00034  hypothetical protein  45.45 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0706545  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  42.93 
 
 		 265 aa  149  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0033  dihydrodipicolinate reductase  45.45 
 
 		 273 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  42.65 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  42.34 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  41.67 
 
 		 268 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  37.55 
 
 		 270 aa  148  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  42.35 
 
 		 267 aa  148  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  42.35 
 
 		 270 aa  148  8e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  41.33 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  44.16 
 
 		 271 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  40.55 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  43.43 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  42.35 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  41.5 
 
 		 269 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  41.71 
 
 		 267 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  42.71 
 
 		 267 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  41.37 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0994  dihydrodipicolinate reductase  40.31 
 
 		 270 aa  143  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  41.03 
 
 		 278 aa  143  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  43.08 
 
 		 273 aa  142  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  46.91 
 
 		 267 aa  142  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  41.62 
 
 		 267 aa  142  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  36.54 
 
 		 268 aa  142  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  41.84 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3278  dihydrodipicolinate reductase  40.16 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.421535  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  36.43 
 
 		 274 aa  142  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  41.21 
 
 		 267 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  41.21 
 
 		 267 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  34.39 
 
 		 270 aa  141  7e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  42.35 
 
 		 267 aa  141  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  41.84 
 
 		 267 aa  141  9e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  40.2 
 
 		 266 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  40.61 
 
 		 265 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  42.56 
 
 		 273 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  35.43 
 
 		 271 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  41.04 
 
 		 268 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  44 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0591  dihydrodipicolinate reductase  41.84 
 
 		 273 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  41.04 
 
 		 268 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  42 
 
 		 284 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  40.7 
 
 		 267 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  41.75 
 
 		 242 aa  139  3.9999999999999997e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1272  dihydrodipicolinate reductase  41.95 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000793767  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  37.99 
 
 		 265 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  33.82 
 
 		 217 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  34.78 
 
 		 270 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  34.78 
 
 		 270 aa  138  6e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  42.78 
 
 		 242 aa  138  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  36.15 
 
 		 268 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  36.15 
 
 		 268 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  36.15 
 
 		 268 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  41.27 
 
 		 256 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  36.15 
 
 		 268 aa  138  7.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  36.15 
 
 		 268 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  39.91 
 
 		 254 aa  137  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  36.15 
 
 		 268 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  38.46 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  35.27 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  34.3 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  40.21 
 
 		 271 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1898  dihydrodipicolinate reductase  45.83 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301098  normal  0.262689 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  35.27 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  40.51 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  35.27 
 
 		 270 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>