More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2439 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2439  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 264 aa  506  9.999999999999999e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0628599  normal  0.395118 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  43.91 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  46.52 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  43.49 
 
 		 266 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  43.91 
 
 		 271 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4068  dihydrodipicolinate reductase  46.91 
 
 		 270 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  47.6 
 
 		 268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4216  dihydrodipicolinate reductase  47.27 
 
 		 270 aa  198  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0940051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  42.65 
 
 		 267 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  41.7 
 
 		 278 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4191  dihydrodipicolinate reductase  47.27 
 
 		 270 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  40.59 
 
 		 276 aa  196  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1898  dihydrodipicolinate reductase  48.71 
 
 		 267 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301098  normal  0.262689 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  44.44 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  40.44 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  40.89 
 
 		 275 aa  196  3e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  44.11 
 
 		 261 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1525  dihydrodipicolinate reductase  44.24 
 
 		 259 aa  195  6e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150492  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  43.89 
 
 		 259 aa  195  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  43.87 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  44.61 
 
 		 284 aa  193  2e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  47.41 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  41.64 
 
 		 273 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 		 267 aa  193  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  41.79 
 
 		 263 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  42.7 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  43.75 
 
 		 267 aa  191  8e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  39.11 
 
 		 266 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  40.89 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  40.89 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 		 263 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  40.89 
 
 		 273 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  40.37 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0803  dihydrodipicolinate reductase  41.22 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.737849  normal  0.659489 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  42.07 
 
 		 267 aa  189  2.9999999999999997e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  41.48 
 
 		 268 aa  188  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  40.15 
 
 		 273 aa  188  8e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  41.04 
 
 		 273 aa  188  9e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  44.98 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  43.7 
 
 		 271 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  45.9 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 		 273 aa  188  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0450  dihydrodipicolinate reductase  42.97 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.303901 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  44.61 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1070  dihydrodipicolinate reductase  43.49 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  42.01 
 
 		 268 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  41.04 
 
 		 273 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  43.02 
 
 		 259 aa  186  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  41.11 
 
 		 268 aa  185  6e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  38.38 
 
 		 266 aa  185  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  41.04 
 
 		 269 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  42.31 
 
 		 267 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  41.85 
 
 		 265 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  37.64 
 
 		 267 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  37.64 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  40.22 
 
 		 273 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  38.38 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  38.97 
 
 		 267 aa  183  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  43.12 
 
 		 272 aa  182  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 273 aa  182  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00034  hypothetical protein  41.26 
 
 		 273 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0706545  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  41.33 
 
 		 289 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0033  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 273 aa  182  6e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  40.37 
 
 		 268 aa  182  7e-45  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  41.11 
 
 		 270 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  43.12 
 
 		 265 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  41.18 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  39.85 
 
 		 267 aa  181  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  42.59 
 
 		 288 aa  180  2e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  40.3 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0035  dihydrodipicolinate reductase  40.89 
 
 		 273 aa  180  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0335  dihydrodipicolinate reductase  43.87 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.332149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  39.63 
 
 		 271 aa  180  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  40.44 
 
 		 267 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  40.74 
 
 		 271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  39.48 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  39.48 
 
 		 269 aa  179  4e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  40.07 
 
 		 267 aa  179  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  40.15 
 
 		 268 aa  179  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  40.74 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  40.29 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  40.29 
 
 		 267 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  41.79 
 
 		 278 aa  179  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  38.52 
 
 		 265 aa  178  5.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  39.41 
 
 		 271 aa  178  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  41.42 
 
 		 269 aa  178  7e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0385  dihydrodipicolinate reductase  42.44 
 
 		 271 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 		 270 aa  178  7e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  40.29 
 
 		 267 aa  178  8e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  43.73 
 
 		 244 aa  178  8e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  38.6 
 
 		 267 aa  178  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>