More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0204 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0204  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 252 aa  494  1e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  59.13 
 
 		 241 aa  253  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  59.06 
 
 		 242 aa  253  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  50.76 
 
 		 265 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  50.38 
 
 		 265 aa  205  5e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2959  dihydrodipicolinate reductase  49.06 
 
 		 272 aa  203  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  50.19 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  48.87 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0132  dihydrodipicolinate reductase  48.11 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.517798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2435  dihydrodipicolinate reductase  47.55 
 
 		 267 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 		 279 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 		 268 aa  194  1e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  44.7 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  45.66 
 
 		 265 aa  187  1e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0154  dihydrodipicolinate reductase  47.04 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3592  dihydrodipicolinate reductase  46.27 
 
 		 277 aa  185  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.515534  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1051  dihydrodipicolinate reductase  44.53 
 
 		 268 aa  185  5e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0214787  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  46.54 
 
 		 277 aa  185  8e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  46.99 
 
 		 244 aa  182  3e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  45.67 
 
 		 256 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  41.11 
 
 		 267 aa  181  8.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  40.37 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  44.32 
 
 		 288 aa  181  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  44.24 
 
 		 271 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  40.37 
 
 		 268 aa  181  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4037  dihydrodipicolinate reductase  44.36 
 
 		 269 aa  180  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  44.19 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  43.38 
 
 		 267 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  43.94 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2798  dihydrodipicolinate reductase  44.36 
 
 		 268 aa  178  8e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.330088  normal  0.472003 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  40.52 
 
 		 267 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  42.59 
 
 		 268 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0087  dihydrodipicolinate reductase  44.57 
 
 		 269 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  40.89 
 
 		 267 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1055  dihydrodipicolinate reductase  46.8 
 
 		 247 aa  176  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  41.42 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  41.42 
 
 		 268 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  41.42 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  41.42 
 
 		 268 aa  175  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  41.42 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  41.42 
 
 		 268 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  41.73 
 
 		 265 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  41.11 
 
 		 267 aa  175  6e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  39.03 
 
 		 267 aa  174  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  41.04 
 
 		 278 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  42.44 
 
 		 267 aa  174  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1105  dihydrodipicolinate reductase  42.48 
 
 		 269 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.32812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  45.98 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  41.11 
 
 		 268 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4127  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 		 274 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  40.75 
 
 		 265 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  41.18 
 
 		 268 aa  174  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2767  dihydrodipicolinate reductase  42.11 
 
 		 269 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  40.52 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  39.55 
 
 		 269 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4441  dihydrodipicolinate reductase  44.74 
 
 		 274 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8646 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  40.38 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  40.52 
 
 		 267 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  38.06 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  41.7 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  41.26 
 
 		 268 aa  171  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2925  dihydrodipicolinate reductase  42.32 
 
 		 269 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.058747  normal  0.091459 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  37.55 
 
 		 278 aa  171  1e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  40.96 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  39.62 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3040  dihydrodipicolinate reductase  42.86 
 
 		 269 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.787809 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  40.75 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  39.62 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  40 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  39.62 
 
 		 265 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  43.65 
 
 		 246 aa  170  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  45.49 
 
 		 256 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0579  dihydrodipicolinate reductase  37.08 
 
 		 267 aa  168  6e-41  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00865332  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  40.59 
 
 		 271 aa  169  6e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0443  dihydrodipicolinate reductase  37.22 
 
 		 267 aa  168  7e-41  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 		 266 aa  167  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  39.25 
 
 		 265 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  38.6 
 
 		 267 aa  167  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  37.94 
 
 		 251 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3371  dihydrodipicolinate reductase  44.74 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  35.83 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0231  dihydrodipicolinate reductase  38.43 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  36.47 
 
 		 254 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  39.53 
 
 		 242 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0573  dihydrodipicolinate reductase  40.45 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  37.04 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1971  dihydrodipicolinate reductase  43.7 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.744905 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  38.35 
 
 		 275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0435  dihydrodipicolinate reductase  44.32 
 
 		 271 aa  165  5e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  39.93 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  41.48 
 
 		 267 aa  165  5.9999999999999996e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  39.92 
 
 		 251 aa  165  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 		 266 aa  165  8e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  37.78 
 
 		 269 aa  165  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  43.02 
 
 		 251 aa  164  9e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  38.38 
 
 		 269 aa  164  9e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  41.2 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>