More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2054 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2054  Dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 248 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0324  dihydrodipicolinate reductase  75 
 
 		 248 aa  377  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0110233 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2437  Dihydrodipicolinate reductase  71.37 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2095  dihydrodipicolinate reductase  70.97 
 
 		 248 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1886  Dihydrodipicolinate reductase  66.8 
 
 		 248 aa  357  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2084  Dihydrodipicolinate reductase  68.83 
 
 		 248 aa  354  6.999999999999999e-97  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1805  dihydrodipicolinate reductase  68.02 
 
 		 249 aa  343  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3529  dihydrodipicolinate reductase  39.76 
 
 		 246 aa  175  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1657  dihydrodipicolinate reductase  39.04 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2028  dihydrodipicolinate reductase  34.55 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0205  dihydrodipicolinate reductase  36.48 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2002  dihydrodipicolinate reductase  36 
 
 		 238 aa  148  8e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07100  dihydrodipicolinate reductase  34.82 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  34.84 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2563  dihydrodipicolinate reductase  34.29 
 
 		 239 aa  143  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.850581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0244  dihydrodipicolinate reductase  32.39 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432587 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  35.17 
 
 		 263 aa  137  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  35.02 
 
 		 263 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  33.2 
 
 		 269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0209  dihydrodipicolinate reductase  34.66 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00185841  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  34.24 
 
 		 255 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  33.98 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2492  dihydrodipicolinate reductase  32.94 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  34.65 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  32.18 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  37.62 
 
 		 257 aa  122  6e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  35.78 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  35.78 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  37.74 
 
 		 268 aa  117  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  32.48 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0304  hypothetical protein  29.6 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.400774 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  28.98 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  33.99 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0370  dihydrodipicolinate reductase  31.78 
 
 		 261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  34.76 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  32 
 
 		 266 aa  113  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  36.27 
 
 		 267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  34.02 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  33.6 
 
 		 259 aa  112  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  34.02 
 
 		 267 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  34.27 
 
 		 264 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  33.76 
 
 		 269 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  32.95 
 
 		 251 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  35.71 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  30.68 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  33.61 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  31.36 
 
 		 269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  31.3 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  33.18 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  33.01 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  29.45 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  33.76 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  35.15 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  32.34 
 
 		 254 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  32.35 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  34.69 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  35.5 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  32.81 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  32.11 
 
 		 268 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  33.2 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1525  dihydrodipicolinate reductase  31.7 
 
 		 259 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150492  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  31.35 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  30.91 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  28.83 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  35.92 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  28.57 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1763  dihydrodipicolinate reductase  32.95 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  33.07 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0730  dihydrodipicolinate reductase  31.43 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14973  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  35.29 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  31.68 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  33.47 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  32.68 
 
 		 267 aa  105  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  31.66 
 
 		 252 aa  105  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  30.94 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  32.92 
 
 		 242 aa  105  8e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0216  dihydrodipicolinate reductase  30.17 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  30.94 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  30.3 
 
 		 267 aa  105  9e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  29.35 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  32.55 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  34.38 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  32.38 
 
 		 268 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  32.93 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  32.11 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  33.98 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  30.2 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  29.35 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3170  dihydrodipicolinate reductase  34.38 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.275412 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  32.92 
 
 		 241 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  30.74 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  33.99 
 
 		 271 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  34.12 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  33 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>