More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1886 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1886  Dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 248 aa  507  1e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2084  Dihydrodipicolinate reductase  74.19 
 
 		 248 aa  387  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2437  Dihydrodipicolinate reductase  70.85 
 
 		 248 aa  361  7.0000000000000005e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2054  Dihydrodipicolinate reductase  66.8 
 
 		 248 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0324  dihydrodipicolinate reductase  68.02 
 
 		 248 aa  346  2e-94  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0110233 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2095  dihydrodipicolinate reductase  67.21 
 
 		 248 aa  341  8e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1805  dihydrodipicolinate reductase  64.11 
 
 		 249 aa  320  9.999999999999999e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1657  dihydrodipicolinate reductase  37.94 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3529  dihydrodipicolinate reductase  35.66 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2002  dihydrodipicolinate reductase  37.25 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2028  dihydrodipicolinate reductase  33.61 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0205  dihydrodipicolinate reductase  37.14 
 
 		 233 aa  151  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07100  dihydrodipicolinate reductase  34.01 
 
 		 238 aa  151  1e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2563  dihydrodipicolinate reductase  35.37 
 
 		 239 aa  149  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.850581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  34.02 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0244  dihydrodipicolinate reductase  32.39 
 
 		 244 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432587 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  34.51 
 
 		 269 aa  138  7e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  37.5 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  33.2 
 
 		 251 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0209  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 237 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00185841  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  33.87 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  38.5 
 
 		 263 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  34.39 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2492  dihydrodipicolinate reductase  34.66 
 
 		 226 aa  124  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_002978  WD0370  dihydrodipicolinate reductase  35.89 
 
 		 261 aa  122  5e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  32.84 
 
 		 267 aa  121  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  33.98 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  33.99 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  30.74 
 
 		 270 aa  120  3e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  33.87 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0304  hypothetical protein  28.46 
 
 		 240 aa  118  7e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.400774 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  31.42 
 
 		 267 aa  118  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  31.15 
 
 		 268 aa  118  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  32.18 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  31.42 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  31.97 
 
 		 273 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  32.34 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  32.34 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  32.34 
 
 		 273 aa  115  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  30.86 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  30.11 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1763  dihydrodipicolinate reductase  34.54 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  32.55 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  32.22 
 
 		 265 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  32.71 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  31.23 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  33.75 
 
 		 246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  35.15 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  31.73 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  32.27 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  32.22 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  30.89 
 
 		 252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  36.14 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  32.34 
 
 		 273 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  34.56 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  35.68 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0035  dihydrodipicolinate reductase  32.59 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  30.48 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  34.16 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1525  dihydrodipicolinate reductase  33.47 
 
 		 259 aa  110  3e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150492  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  30.54 
 
 		 242 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  29.23 
 
 		 278 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  32.02 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  29.23 
 
 		 276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  31.73 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  35.35 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  30.54 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  32.22 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  32.22 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  29.62 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  32.22 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  32.22 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  32.22 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00034  hypothetical protein  32.22 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0706545  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  35.64 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  32.22 
 
 		 273 aa  108  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0033  dihydrodipicolinate reductase  32.22 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  31.73 
 
 		 273 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  33.6 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  29.39 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  32.81 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  31.73 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  31.3 
 
 		 267 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  35.78 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  34.63 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  29.39 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  30.19 
 
 		 267 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  29.85 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2439  dihydrodipicolinate reductase  36.89 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0628599  normal  0.395118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  31.92 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  30.92 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  34.83 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  27.21 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  32.74 
 
 		 275 aa  106  4e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  37.13 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  31.15 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3170  dihydrodipicolinate reductase  31.46 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.275412 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  32.42 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  31.11 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  33.82 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>