More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0244 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0244  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 244 aa  508  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432587 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0209  dihydrodipicolinate reductase  64.61 
 
 		 237 aa  318  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00185841  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2563  dihydrodipicolinate reductase  60.74 
 
 		 239 aa  304  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.850581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2028  dihydrodipicolinate reductase  52.48 
 
 		 238 aa  262  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0304  hypothetical protein  50 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.400774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3529  dihydrodipicolinate reductase  50.21 
 
 		 246 aa  260  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  52.67 
 
 		 233 aa  251  6e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0205  dihydrodipicolinate reductase  53.72 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07100  dihydrodipicolinate reductase  51.44 
 
 		 238 aa  244  8e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2002  dihydrodipicolinate reductase  47.33 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2492  dihydrodipicolinate reductase  38.78 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1657  dihydrodipicolinate reductase  36.69 
 
 		 252 aa  156  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2095  dihydrodipicolinate reductase  35.2 
 
 		 248 aa  151  7e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0324  dihydrodipicolinate reductase  33.47 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0110233 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2437  Dihydrodipicolinate reductase  34.4 
 
 		 248 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1886  Dihydrodipicolinate reductase  32.39 
 
 		 248 aa  142  7e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2054  Dihydrodipicolinate reductase  32.39 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2084  Dihydrodipicolinate reductase  30.77 
 
 		 248 aa  135  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1805  dihydrodipicolinate reductase  34 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  37.84 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  32.84 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  37.86 
 
 		 270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  33.59 
 
 		 252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  38.28 
 
 		 267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  32.27 
 
 		 255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1414  dihydrodipicolinate reductase  33.47 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0054819  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1272  dihydrodipicolinate reductase  33.06 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000793767  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  36.68 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3579  dihydrodipicolinate reductase  33.97 
 
 		 271 aa  122  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0145714  normal  0.121498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  36.89 
 
 		 284 aa  121  9e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  36.19 
 
 		 266 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  32.31 
 
 		 254 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  34.43 
 
 		 242 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  34.46 
 
 		 259 aa  120  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  35.42 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  36.53 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  32.16 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  32.43 
 
 		 266 aa  118  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3402  dihydrodipicolinate reductase  31.92 
 
 		 270 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000810417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1050  dihydrodipicolinate reductase  31.92 
 
 		 270 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000677539  hitchhiker  0.00000153005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3306  dihydrodipicolinate reductase  31.92 
 
 		 270 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000173903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3527  dihydrodipicolinate reductase  31.92 
 
 		 270 aa  118  9e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0063333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  36.18 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  36.82 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  35.75 
 
 		 273 aa  117  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  36.7 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  38.69 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  39.22 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3405  dihydrodipicolinate reductase  32.82 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.408916  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  36.07 
 
 		 269 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  37.21 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0964  dihydrodipicolinate reductase  33.72 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000624592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1002  dihydrodipicolinate reductase  33.72 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00177557  normal  0.985837 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  35.77 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  39.15 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  34.1 
 
 		 261 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1140  dihydrodipicolinate reductase  33.72 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  36.53 
 
 		 278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  36.53 
 
 		 276 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2941  dihydrodipicolinate reductase  31.54 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00113779  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  36.07 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  36.07 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  30.31 
 
 		 254 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0519  dihydrodipicolinate reductase  35.03 
 
 		 284 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  34.76 
 
 		 268 aa  115  8.999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  35 
 
 		 266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0966  dihydrodipicolinate reductase  35.07 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000239889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  33.47 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  36.68 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  37.75 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  35.62 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  35.82 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  36.68 
 
 		 263 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  36.41 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  35.89 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  38.19 
 
 		 263 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  35.91 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3076  dihydrodipicolinate reductase  32.44 
 
 		 274 aa  113  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00138759  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  35.62 
 
 		 267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  34.11 
 
 		 273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  34.71 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  35.12 
 
 		 244 aa  113  4.0000000000000004e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1486  dihydrodipicolinate reductase  33.72 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  30.65 
 
 		 251 aa  112  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1457  dihydrodipicolinate reductase  33.72 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46202  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  38.31 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  35.75 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  35.45 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  32.02 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  33.09 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  36.45 
 
 		 269 aa  111  8.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  34.12 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  36.95 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  35.75 
 
 		 269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  34.3 
 
 		 273 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>