More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0304 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010830  Aasi_0304  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  496  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.400774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2563  dihydrodipicolinate reductase  52.1 
 
 		 239 aa  281  9e-75  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.850581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0244  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 		 244 aa  261  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432587 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2028  dihydrodipicolinate reductase  50 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0209  dihydrodipicolinate reductase  47.9 
 
 		 237 aa  246  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00185841  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  51.05 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0205  dihydrodipicolinate reductase  48.97 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07100  dihydrodipicolinate reductase  44.17 
 
 		 238 aa  223  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3529  dihydrodipicolinate reductase  42.28 
 
 		 246 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2002  dihydrodipicolinate reductase  42.44 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1657  dihydrodipicolinate reductase  34.02 
 
 		 252 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2492  dihydrodipicolinate reductase  34.17 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2095  dihydrodipicolinate reductase  30.92 
 
 		 248 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  29.63 
 
 		 269 aa  131  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2437  Dihydrodipicolinate reductase  30.24 
 
 		 248 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0324  dihydrodipicolinate reductase  28.23 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0110233 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1886  Dihydrodipicolinate reductase  28.46 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2054  Dihydrodipicolinate reductase  29.6 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2084  Dihydrodipicolinate reductase  27.64 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  34.48 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1805  dihydrodipicolinate reductase  29.72 
 
 		 249 aa  108  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  27.99 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  31.66 
 
 		 263 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  30.2 
 
 		 278 aa  105  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  29.29 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  31.16 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  30.58 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  29.52 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  27.04 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  33.17 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0035  dihydrodipicolinate reductase  32.21 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  29.85 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  32.21 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  32.21 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00034  hypothetical protein  32.21 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0706545  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  32.21 
 
 		 273 aa  102  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  30.58 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  31.73 
 
 		 273 aa  101  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  31.73 
 
 		 273 aa  101  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  31.73 
 
 		 273 aa  101  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0033  dihydrodipicolinate reductase  31.73 
 
 		 273 aa  101  9e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  29.96 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  30.62 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  30.62 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  30.62 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  30.62 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  29.96 
 
 		 242 aa  100  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  30.43 
 
 		 270 aa  99.4  4e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  30.58 
 
 		 273 aa  99.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  30.69 
 
 		 267 aa  99  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  28.21 
 
 		 267 aa  99  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  31.16 
 
 		 263 aa  98.6  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  28.68 
 
 		 267 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  26.87 
 
 		 265 aa  97.8  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  31.67 
 
 		 259 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  27.41 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  28.21 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  31.68 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  28.37 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  28.21 
 
 		 267 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  29.27 
 
 		 267 aa  97.4  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  27.24 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  31.02 
 
 		 273 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  31.74 
 
 		 217 aa  97.1  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  30.41 
 
 		 257 aa  97.1  2e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  29.35 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  26.87 
 
 		 265 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  28.68 
 
 		 267 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  31.91 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  31.6 
 
 		 273 aa  95.9  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  31.6 
 
 		 273 aa  95.9  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2735  dihydrodipicolinate reductase  27.86 
 
 		 265 aa  95.9  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.932865 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  28.22 
 
 		 273 aa  95.9  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  30.35 
 
 		 242 aa  95.9  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1223  dihydrodipicolinate reductase  31 
 
 		 212 aa  95.5  7e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1272  dihydrodipicolinate reductase  29.82 
 
 		 216 aa  95.5  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000793767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  28.28 
 
 		 265 aa  95.1  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  29.27 
 
 		 248 aa  95.1  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  28.21 
 
 		 267 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1414  dihydrodipicolinate reductase  28.95 
 
 		 216 aa  95.1  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0054819  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  28.64 
 
 		 254 aa  95.1  9e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  30.85 
 
 		 271 aa  94.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  28.31 
 
 		 267 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  28.16 
 
 		 252 aa  94.4  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  27.72 
 
 		 273 aa  94.4  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  31.13 
 
 		 273 aa  94  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  29.7 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  29.29 
 
 		 271 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0730  dihydrodipicolinate reductase  28.93 
 
 		 270 aa  93.6  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14973  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0168  dihydrodipicolinate reductase  28.28 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.757429  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  30.49 
 
 		 252 aa  94.4  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0651  dihydrodipicolinate reductase  28.28 
 
 		 265 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.387515  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  30.29 
 
 		 268 aa  94  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0803  dihydrodipicolinate reductase  29.28 
 
 		 263 aa  93.6  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.737849  normal  0.659489 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  28.86 
 
 		 265 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  31.34 
 
 		 276 aa  92.8  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0519  dihydrodipicolinate reductase  29.81 
 
 		 284 aa  92.4  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  27.78 
 
 		 270 aa  92.4  5e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  28.29 
 
 		 269 aa  92  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>