More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2437 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2437  Dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 
248 aa  503  1e-141  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0324  dihydrodipicolinate reductase  77.96 
 
 
248 aa  395  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0110233 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2095  dihydrodipicolinate reductase  74.6 
 
 
248 aa  388  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2054  Dihydrodipicolinate reductase  71.37 
 
 
248 aa  375  1e-103  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1805  dihydrodipicolinate reductase  72.65 
 
 
249 aa  365  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1886  Dihydrodipicolinate reductase  70.85 
 
 
248 aa  361  7.0000000000000005e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2084  Dihydrodipicolinate reductase  67.21 
 
 
248 aa  353  2e-96  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1657  dihydrodipicolinate reductase  39.36 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3529  dihydrodipicolinate reductase  37.05 
 
 
246 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2563  dihydrodipicolinate reductase  37.14 
 
 
239 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.850581  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2028  dihydrodipicolinate reductase  33.74 
 
 
238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0244  dihydrodipicolinate reductase  34.4 
 
 
244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00432587 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07100  dihydrodipicolinate reductase  35.48 
 
 
238 aa  145  5e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0209  dihydrodipicolinate reductase  36.95 
 
 
237 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00185841  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  36.44 
 
 
269 aa  142  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  34.43 
 
 
233 aa  141  9e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2002  dihydrodipicolinate reductase  35.37 
 
 
238 aa  141  9.999999999999999e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  36.05 
 
 
263 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0205  dihydrodipicolinate reductase  34.84 
 
 
233 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  35.14 
 
 
251 aa  138  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  38.61 
 
 
263 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  34.55 
 
 
252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2492  dihydrodipicolinate reductase  36 
 
 
226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  34.54 
 
 
252 aa  124  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0370  dihydrodipicolinate reductase  35.21 
 
 
261 aa  123  2e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0304  hypothetical protein  30.24 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.400774 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0114  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 
265 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.878152 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  34.57 
 
 
246 aa  120  1.9999999999999998e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  32.68 
 
 
255 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  36.1 
 
 
256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  36.82 
 
 
257 aa  119  6e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  35.12 
 
 
267 aa  118  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  36.14 
 
 
254 aa  118  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  34.75 
 
 
267 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  36.76 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  33.08 
 
 
251 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  33.73 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  34.75 
 
 
267 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  33.01 
 
 
267 aa  116  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 
268 aa  116  3e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  33.19 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  31.62 
 
 
273 aa  115  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  36.45 
 
 
269 aa  115  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  31.62 
 
 
273 aa  115  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1358  dihydrodipicolinate reductase  32.14 
 
 
258 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0298  dihydrodipicolinate reductase  32 
 
 
254 aa  115  8.999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.521005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  34.54 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  33.47 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  31.25 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  32.64 
 
 
242 aa  113  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  33.66 
 
 
267 aa  113  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  32.24 
 
 
273 aa  113  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  31.8 
 
 
242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  33.49 
 
 
273 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0989  dihydrodipicolinate reductase  34.77 
 
 
279 aa  112  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  35.24 
 
 
267 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  31.8 
 
 
242 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  32.35 
 
 
276 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 
269 aa  112  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  35.96 
 
 
273 aa  111  9e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  28.85 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1051  dihydrodipicolinate reductase  34.77 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.799147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  31.68 
 
 
266 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  34.63 
 
 
255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  35.15 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  32.25 
 
 
272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  34.01 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  34.88 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0004  dihydrodipicolinate reductase  35.32 
 
 
242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  29.41 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0445  dihydrodipicolinate reductase  34.91 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.740885  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  30.97 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  28.85 
 
 
266 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 
241 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  33.05 
 
 
259 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2066  dihydrodipicolinate reductase  35.51 
 
 
265 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.531421  normal  0.010267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  33.89 
 
 
267 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1330  dihydrodipicolinate reductase  35.9 
 
 
277 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  34.8 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  31.09 
 
 
248 aa  109  4.0000000000000004e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  32.67 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  33.89 
 
 
267 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  30.57 
 
 
267 aa  109  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  32.67 
 
 
273 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  32.67 
 
 
273 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  32.67 
 
 
273 aa  108  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  32.67 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 
267 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1763  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 
231 aa  108  9.000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  31.4 
 
 
269 aa  107  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  35.5 
 
 
252 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 
273 aa  107  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  33.21 
 
 
267 aa  107  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 
273 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  33.21 
 
 
267 aa  107  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  33.79 
 
 
284 aa  107  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  33.47 
 
 
267 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0755  dihydrodipicolinate reductase  31.23 
 
 
271 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  28.08 
 
 
266 aa  106  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>