More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2028 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2028  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 238 aa  493  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3529  dihydrodipicolinate reductase  51.84 
 
 		 246 aa  276  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2563  dihydrodipicolinate reductase  55.46 
 
 		 239 aa  275  4e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.850581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  56.72 
 
 		 233 aa  271  9e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07100  dihydrodipicolinate reductase  51.68 
 
 		 238 aa  264  7e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0244  dihydrodipicolinate reductase  52.48 
 
 		 244 aa  262  4e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432587 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0205  dihydrodipicolinate reductase  55.88 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0304  hypothetical protein  50 
 
 		 240 aa  256  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.400774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0209  dihydrodipicolinate reductase  50.42 
 
 		 237 aa  253  2.0000000000000002e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00185841  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_002950  PG2002  dihydrodipicolinate reductase  47.9 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1657  dihydrodipicolinate reductase  37.86 
 
 		 252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2095  dihydrodipicolinate reductase  36.99 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2084  Dihydrodipicolinate reductase  34.43 
 
 		 248 aa  155  7e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1886  Dihydrodipicolinate reductase  33.61 
 
 		 248 aa  152  5e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2054  Dihydrodipicolinate reductase  34.55 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2492  dihydrodipicolinate reductase  36.55 
 
 		 226 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2437  Dihydrodipicolinate reductase  33.74 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0324  dihydrodipicolinate reductase  34.15 
 
 		 248 aa  145  5e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0110233 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1805  dihydrodipicolinate reductase  35.1 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  31.58 
 
 		 269 aa  132  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  36.32 
 
 		 263 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  32.96 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  33.88 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  35.75 
 
 		 267 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1414  dihydrodipicolinate reductase  32.64 
 
 		 216 aa  114  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0054819  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  31.6 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1272  dihydrodipicolinate reductase  32.22 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000793767  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  29.96 
 
 		 267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  34.12 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  32.52 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  33 
 
 		 273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  32.1 
 
 		 251 aa  109  5e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  35.78 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  33.17 
 
 		 266 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  30 
 
 		 267 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  33 
 
 		 273 aa  108  9.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  32.67 
 
 		 266 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  32.54 
 
 		 270 aa  107  1e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0519  dihydrodipicolinate reductase  29.92 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  33.99 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  35 
 
 		 259 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  30.29 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 273 aa  105  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  29.74 
 
 		 267 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  27.84 
 
 		 254 aa  104  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  33 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  32.06 
 
 		 262 aa  103  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  29.96 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 273 aa  103  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  30.33 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  31.23 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0966  dihydrodipicolinate reductase  32.24 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  30.42 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1457  dihydrodipicolinate reductase  32.4 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46202  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1486  dihydrodipicolinate reductase  32.4 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  33.06 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  32.85 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  31.84 
 
 		 267 aa  102  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  33.66 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  32.34 
 
 		 267 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  34.16 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3455  dihydrodipicolinate reductase  32.88 
 
 		 273 aa  102  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0216  dihydrodipicolinate reductase  30.17 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  31.84 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1898  dihydrodipicolinate reductase  30.11 
 
 		 267 aa  101  8e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301098  normal  0.262689 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  33.01 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0221  dihydrodipicolinate reductase  31.25 
 
 		 276 aa  101  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  29.85 
 
 		 267 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 268 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0730  dihydrodipicolinate reductase  28.78 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14973  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  32.84 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0033  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  33.03 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  29.52 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  28.84 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  29.52 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00034  hypothetical protein  33.5 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0706545  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  32.84 
 
 		 273 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0035  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  31.65 
 
 		 284 aa  99.8  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 273 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 273 aa  99.4  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  30.39 
 
 		 267 aa  99.4  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  30.77 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 265 aa  99  6e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  34.5 
 
 		 266 aa  98.6  7e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  31.34 
 
 		 259 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  29.15 
 
 		 254 aa  98.2  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  32.18 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>