More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1805 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1805  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 249 aa  507  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2437  Dihydrodipicolinate reductase  72.65 
 
 		 248 aa  380  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0324  dihydrodipicolinate reductase  72.47 
 
 		 248 aa  377  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0110233 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2095  dihydrodipicolinate reductase  70.45 
 
 		 248 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2054  Dihydrodipicolinate reductase  68.02 
 
 		 248 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2084  Dihydrodipicolinate reductase  64.92 
 
 		 248 aa  344  7e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1886  Dihydrodipicolinate reductase  64.11 
 
 		 248 aa  334  9e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1657  dihydrodipicolinate reductase  39.68 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3529  dihydrodipicolinate reductase  36.25 
 
 		 246 aa  166  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2563  dihydrodipicolinate reductase  36.33 
 
 		 239 aa  151  8.999999999999999e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.850581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2028  dihydrodipicolinate reductase  35.1 
 
 		 238 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0244  dihydrodipicolinate reductase  34 
 
 		 244 aa  141  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432587 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0205  dihydrodipicolinate reductase  36.89 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0209  dihydrodipicolinate reductase  37.25 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00185841  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  32.79 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  34.8 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  34.14 
 
 		 251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  36.47 
 
 		 257 aa  135  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07100  dihydrodipicolinate reductase  33.88 
 
 		 238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  37.44 
 
 		 263 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  34.48 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_002950  PG2002  dihydrodipicolinate reductase  34.54 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  33.46 
 
 		 267 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  38.81 
 
 		 263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  36.51 
 
 		 252 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0370  dihydrodipicolinate reductase  31.64 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2492  dihydrodipicolinate reductase  35.86 
 
 		 226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  31.73 
 
 		 266 aa  125  6e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  35.15 
 
 		 242 aa  125  7e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  36.21 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  32.94 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  36.95 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  33.89 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  33.89 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0055  dihydrodipicolinate reductase  32.45 
 
 		 267 aa  122  7e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1474  dihydrodipicolinate reductase  35.89 
 
 		 267 aa  121  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  37.13 
 
 		 269 aa  121  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  32.42 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  35.24 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  32.23 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  34.63 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  37.62 
 
 		 267 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  37.62 
 
 		 269 aa  119  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  36.14 
 
 		 269 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  36.45 
 
 		 270 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  38.73 
 
 		 267 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  37.13 
 
 		 268 aa  119  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  32.64 
 
 		 248 aa  119  6e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  36.76 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  35.27 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  36.95 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  32.6 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0304  hypothetical protein  29.72 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.400774 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  31.06 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  37.09 
 
 		 269 aa  117  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  33.76 
 
 		 266 aa  116  3e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 251 aa  116  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  37.07 
 
 		 267 aa  116  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 266 aa  115  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  31.76 
 
 		 259 aa  115  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  34.78 
 
 		 273 aa  115  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  35.89 
 
 		 267 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  37.07 
 
 		 268 aa  115  6.9999999999999995e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  35.71 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  36.27 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  34.76 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  36.45 
 
 		 273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  36.1 
 
 		 241 aa  113  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  38.12 
 
 		 264 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  34.55 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  32.26 
 
 		 251 aa  112  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  34.63 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  36.59 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  32.38 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  36.59 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1525  dihydrodipicolinate reductase  32.06 
 
 		 259 aa  111  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150492  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0068  dihydrodipicolinate reductase  34.65 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  35.96 
 
 		 271 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0069  dihydrodipicolinate reductase  34.65 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  32.85 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0071  dihydrodipicolinate reductase  34.65 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  32.37 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  29.66 
 
 		 273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  36.27 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2555  dihydrodipicolinate reductase  34.68 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.649079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  34.1 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0980  dihydrodipicolinate reductase  32.94 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.288189  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  36.27 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0298  dihydrodipicolinate reductase  31.89 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.521005  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  29.28 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  35.15 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  33.66 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2244  dihydrodipicolinate reductase  32.93 
 
 		 256 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.69497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  36.1 
 
 		 267 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  31.99 
 
 		 270 aa  110  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>