More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0205 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0205  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 233 aa  478  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  60.09 
 
 		 233 aa  298  5e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07100  dihydrodipicolinate reductase  57.45 
 
 		 238 aa  280  2e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3529  dihydrodipicolinate reductase  54.47 
 
 		 246 aa  265  5e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0209  dihydrodipicolinate reductase  56.3 
 
 		 237 aa  259  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00185841  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2563  dihydrodipicolinate reductase  55.23 
 
 		 239 aa  257  1e-67  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.850581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2028  dihydrodipicolinate reductase  55.88 
 
 		 238 aa  256  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0244  dihydrodipicolinate reductase  53.72 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432587 
 
 
-
 
NC_002950  PG2002  dihydrodipicolinate reductase  50.42 
 
 		 238 aa  238  5e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0304  hypothetical protein  48.97 
 
 		 240 aa  233  1.0000000000000001e-60  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.400774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2492  dihydrodipicolinate reductase  39.24 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1657  dihydrodipicolinate reductase  35.54 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2095  dihydrodipicolinate reductase  39.34 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1886  Dihydrodipicolinate reductase  37.14 
 
 		 248 aa  151  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2054  Dihydrodipicolinate reductase  36.48 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  35.65 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0324  dihydrodipicolinate reductase  36.07 
 
 		 248 aa  144  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0110233 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2437  Dihydrodipicolinate reductase  34.84 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2084  Dihydrodipicolinate reductase  33.61 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1414  dihydrodipicolinate reductase  35.34 
 
 		 216 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0054819  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1805  dihydrodipicolinate reductase  36.89 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1272  dihydrodipicolinate reductase  34.91 
 
 		 216 aa  129  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000793767  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  39.8 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  33.2 
 
 		 255 aa  121  8e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  36.6 
 
 		 217 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  38.46 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  38.29 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  35.02 
 
 		 265 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  33.85 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  38.24 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  37 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  38.24 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0473  dihydrodipicolinate reductase  33.47 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.380071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  35.06 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  36.52 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  33.06 
 
 		 254 aa  113  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1170  dihydrodipicolinate reductase  31.3 
 
 		 291 aa  112  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  36.41 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  36.63 
 
 		 268 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  37 
 
 		 269 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  36.63 
 
 		 268 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0519  dihydrodipicolinate reductase  36.46 
 
 		 284 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  32.5 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  34.16 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  33.88 
 
 		 251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  34.87 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  33.66 
 
 		 267 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  33.18 
 
 		 300 aa  109  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  37.5 
 
 		 268 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  33.05 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0216  dihydrodipicolinate reductase  35.07 
 
 		 270 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  36.1 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  37.06 
 
 		 251 aa  108  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  34.33 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1898  dihydrodipicolinate reductase  37.06 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.301098  normal  0.262689 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  33.17 
 
 		 268 aa  108  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  36.32 
 
 		 269 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  34.16 
 
 		 267 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  32.34 
 
 		 265 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  32.34 
 
 		 268 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  32.34 
 
 		 268 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  34.65 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  34.65 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  31.34 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  34.65 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  33.66 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  34.12 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  34.65 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  32.86 
 
 		 284 aa  108  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  34.95 
 
 		 265 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  32.36 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  34.16 
 
 		 259 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  33.95 
 
 		 266 aa  106  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0936  dihydrodipicolinate reductase  34.47 
 
 		 268 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  35.86 
 
 		 259 aa  106  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  36.87 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0730  dihydrodipicolinate reductase  34.17 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14973  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  31.7 
 
 		 273 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  30.11 
 
 		 271 aa  106  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  32.37 
 
 		 273 aa  105  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  36.5 
 
 		 276 aa  106  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  32.22 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  34.95 
 
 		 265 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  33.49 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  36.41 
 
 		 254 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0785  dihydrodipicolinate reductase  35.32 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.425853  normal  0.321154 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0041  dihydrodipicolinate reductase  35.54 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.852498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  34.16 
 
 		 267 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 273 aa  105  8e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  32.76 
 
 		 261 aa  105  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  35.32 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  37.07 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  33.04 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  37 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  35.5 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  31.73 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  32.1 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0204  dihydrodipicolinate reductase  33.73 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>