More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_2563 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_2563  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 239 aa  495  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.850581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0244  dihydrodipicolinate reductase  60.74 
 
 		 244 aa  304  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432587 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0304  hypothetical protein  52.1 
 
 		 240 aa  281  9e-75  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.400774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0209  dihydrodipicolinate reductase  57.56 
 
 		 237 aa  280  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00185841  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  57.74 
 
 		 233 aa  278  4e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2028  dihydrodipicolinate reductase  55.46 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3529  dihydrodipicolinate reductase  51.44 
 
 		 246 aa  265  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07100  dihydrodipicolinate reductase  55.97 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0205  dihydrodipicolinate reductase  55.23 
 
 		 233 aa  257  1e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2002  dihydrodipicolinate reductase  47.48 
 
 		 238 aa  244  9.999999999999999e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1657  dihydrodipicolinate reductase  36.99 
 
 		 252 aa  165  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2437  Dihydrodipicolinate reductase  37.14 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2095  dihydrodipicolinate reductase  37.14 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2084  Dihydrodipicolinate reductase  34.15 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2492  dihydrodipicolinate reductase  35.98 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0324  dihydrodipicolinate reductase  34.69 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0110233 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1886  Dihydrodipicolinate reductase  35.37 
 
 		 248 aa  149  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2054  Dihydrodipicolinate reductase  34.29 
 
 		 248 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1805  dihydrodipicolinate reductase  36.33 
 
 		 249 aa  139  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  36.28 
 
 		 263 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  33.85 
 
 		 259 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  33.06 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  35.21 
 
 		 257 aa  120  3e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  32.81 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1414  dihydrodipicolinate reductase  33.75 
 
 		 216 aa  115  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0054819  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  34.76 
 
 		 267 aa  115  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  34.83 
 
 		 252 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0450  dihydrodipicolinate reductase  34.63 
 
 		 259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.303901 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  35.82 
 
 		 270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1272  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000793767  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  32.92 
 
 		 217 aa  113  3e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1457  dihydrodipicolinate reductase  35.04 
 
 		 240 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46202  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1486  dihydrodipicolinate reductase  35.04 
 
 		 240 aa  108  5e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1525  dihydrodipicolinate reductase  32.41 
 
 		 259 aa  109  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.150492  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  30.36 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0966  dihydrodipicolinate reductase  33.6 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  30.04 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  35.64 
 
 		 255 aa  106  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  33 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  32.09 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  35.32 
 
 		 263 aa  106  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  30.7 
 
 		 267 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  30.28 
 
 		 273 aa  105  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 		 267 aa  105  9e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0519  dihydrodipicolinate reductase  37.24 
 
 		 284 aa  104  9e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  31.34 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0803  dihydrodipicolinate reductase  31.25 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.737849  normal  0.659489 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  33.2 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  29.32 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  34.65 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  30.22 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  30.22 
 
 		 266 aa  102  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  32.79 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  29.96 
 
 		 266 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  28.95 
 
 		 263 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  34.78 
 
 		 254 aa  102  4e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  28.73 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  28.73 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4143  dihydrodipicolinate reductase  34.31 
 
 		 267 aa  102  6e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1138  dihydrodipicolinate reductase  31.15 
 
 		 256 aa  101  9e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  29 
 
 		 273 aa  101  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  29.7 
 
 		 263 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0228  dihydrodipicolinate reductase  31.09 
 
 		 242 aa  101  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  32.5 
 
 		 273 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  31.22 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4053  dihydrodipicolinate reductase  34.48 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  28.36 
 
 		 273 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1170  dihydrodipicolinate reductase  31 
 
 		 291 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  31.37 
 
 		 278 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  30.48 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  33.01 
 
 		 269 aa  100  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  27.51 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  33.17 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  32.11 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  31.6 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  31.48 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  31.3 
 
 		 252 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  28.73 
 
 		 267 aa  100  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 		 276 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  28.36 
 
 		 267 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  33 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0190  dihydrodipicolinate reductase  30.67 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  32.18 
 
 		 269 aa  99.8  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0207  dihydrodipicolinate reductase  30.38 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  32.23 
 
 		 268 aa  99  5e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  29.1 
 
 		 267 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  31.12 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  30.83 
 
 		 251 aa  97.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 268 aa  97.8  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0670  dihydrodipicolinate reductase  32.84 
 
 		 273 aa  98.2  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0069  dihydrodipicolinate reductase  35.38 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.936348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  29.04 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  33.99 
 
 		 278 aa  97.4  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3584  dihydrodipicolinate reductase  29.26 
 
 		 273 aa  97.1  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1358  dihydrodipicolinate reductase  33.66 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>