More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1657 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1657  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 252 aa  518  1e-146  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3529  dihydrodipicolinate reductase  41.87 
 
 		 246 aa  194  2e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2095  dihydrodipicolinate reductase  40.39 
 
 		 248 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2084  Dihydrodipicolinate reductase  39.29 
 
 		 248 aa  178  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1886  Dihydrodipicolinate reductase  37.94 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2437  Dihydrodipicolinate reductase  39.36 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2054  Dihydrodipicolinate reductase  39.04 
 
 		 248 aa  174  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2028  dihydrodipicolinate reductase  37.86 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1805  dihydrodipicolinate reductase  39.68 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07100  dihydrodipicolinate reductase  36.36 
 
 		 238 aa  171  1e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2563  dihydrodipicolinate reductase  36.99 
 
 		 239 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.850581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0324  dihydrodipicolinate reductase  39.29 
 
 		 248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0110233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0205  dihydrodipicolinate reductase  35.54 
 
 		 233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  36.03 
 
 		 233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  41.88 
 
 		 269 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0244  dihydrodipicolinate reductase  36.69 
 
 		 244 aa  156  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432587 
 
 
-
 
NC_002950  PG2002  dihydrodipicolinate reductase  36.73 
 
 		 238 aa  152  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0304  hypothetical protein  34.02 
 
 		 240 aa  152  7e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.400774 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0209  dihydrodipicolinate reductase  34.27 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00185841  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2492  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 226 aa  131  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0519  dihydrodipicolinate reductase  34.85 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  38 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1870  dihydrodipicolinate reductase  36.07 
 
 		 255 aa  122  8e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0541167  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  36.21 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  32.79 
 
 		 251 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1486  dihydrodipicolinate reductase  31.2 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1457  dihydrodipicolinate reductase  31.2 
 
 		 240 aa  119  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46202  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  34.43 
 
 		 267 aa  119  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1170  dihydrodipicolinate reductase  30.08 
 
 		 291 aa  118  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  34.62 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4967  dihydrodipicolinate reductase  34.5 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  30.52 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  36.76 
 
 		 259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  30.92 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  33.09 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  36.54 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1582  dihydrodipicolinate reductase  34.87 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00032716  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0173  dihydrodipicolinate reductase  33.03 
 
 		 255 aa  113  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.377884  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1409  dihydrodipicolinate reductase  34.58 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3042  dihydrodipicolinate reductase  29.32 
 
 		 266 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2997  dihydrodipicolinate reductase  33.09 
 
 		 274 aa  112  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0966  dihydrodipicolinate reductase  30.95 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1208  dihydrodipicolinate reductase  32.22 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.290649  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  34.14 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  33.82 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0963  dihydrodipicolinate reductase  29.51 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.157829  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0201  dihydrodipicolinate reductase  32.96 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.599241 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0359  dihydrodipicolinate reductase  35.68 
 
 		 300 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0679708  normal  0.40157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0212  dihydrodipicolinate reductase  30.73 
 
 		 266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.17732  hitchhiker  0.000000000618178 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  29.25 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  29.96 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  31.85 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  28.46 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  31.85 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0342  dihydrodipicolinate reductase  32.59 
 
 		 271 aa  110  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0111037  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  31.85 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  31.85 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1414  dihydrodipicolinate reductase  31.98 
 
 		 216 aa  110  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0054819  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  32.52 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2507  dihydrodipicolinate reductase  33.8 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0837257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2730  dihydrodipicolinate reductase  33.8 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.202172  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3062  dihydrodipicolinate reductase  31.71 
 
 		 267 aa  109  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.304579  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  34.63 
 
 		 284 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  31.85 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  35.27 
 
 		 267 aa  108  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  31.85 
 
 		 268 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  31.85 
 
 		 268 aa  108  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  34.3 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0160  dihydrodipicolinate reductase  32.04 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  32.66 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  34.29 
 
 		 269 aa  108  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2162  dihydrodipicolinate reductase  30.35 
 
 		 254 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.528738  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  34.78 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  33.66 
 
 		 273 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  38.31 
 
 		 259 aa  107  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  32.72 
 
 		 254 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0197  dihydrodipicolinate reductase  31.97 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  30.95 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0158  dihydrodipicolinate reductase  31.6 
 
 		 289 aa  107  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  33.82 
 
 		 273 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3571  dihydrodipicolinate reductase  35.35 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  38.5 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2835  dihydrodipicolinate reductase  32.39 
 
 		 265 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0235  dihydrodipicolinate reductase  30.24 
 
 		 267 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  31.6 
 
 		 270 aa  106  3e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2747  dihydrodipicolinate reductase  34.95 
 
 		 241 aa  106  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.602014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  30.67 
 
 		 278 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  34.25 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1873  dihydrodipicolinate reductase  29.5 
 
 		 254 aa  105  7e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  34.65 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1971  dihydrodipicolinate reductase  34.16 
 
 		 256 aa  105  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.744905 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0803  dihydrodipicolinate reductase  36.5 
 
 		 263 aa  105  9e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.737849  normal  0.659489 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0237  dihydrodipicolinate reductase  31.84 
 
 		 270 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0450  dihydrodipicolinate reductase  38.12 
 
 		 259 aa  104  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.303901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  35.05 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0475  dihydrodipicolinate reductase  33.16 
 
 		 254 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.403473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  35.74 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1272  dihydrodipicolinate reductase  30.77 
 
 		 216 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000793767  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  31.34 
 
 		 267 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>