More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0209 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0209  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 237 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00185841  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0244  dihydrodipicolinate reductase  64.61 
 
 		 244 aa  318  5e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432587 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2563  dihydrodipicolinate reductase  57.56 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.850581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  59.17 
 
 		 233 aa  267  8.999999999999999e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2002  dihydrodipicolinate reductase  52.1 
 
 		 238 aa  261  6.999999999999999e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07100  dihydrodipicolinate reductase  53.97 
 
 		 238 aa  259  2e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0205  dihydrodipicolinate reductase  56.3 
 
 		 233 aa  259  2e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2028  dihydrodipicolinate reductase  50.42 
 
 		 238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0304  hypothetical protein  47.9 
 
 		 240 aa  246  2e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.400774 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3529  dihydrodipicolinate reductase  47.74 
 
 		 246 aa  237  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2492  dihydrodipicolinate reductase  39.08 
 
 		 226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0324  dihydrodipicolinate reductase  36.95 
 
 		 248 aa  146  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0110233 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2095  dihydrodipicolinate reductase  37.35 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2437  Dihydrodipicolinate reductase  36.95 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1657  dihydrodipicolinate reductase  34.27 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  34.02 
 
 		 269 aa  135  4e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1805  dihydrodipicolinate reductase  37.25 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2054  Dihydrodipicolinate reductase  34.66 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2084  Dihydrodipicolinate reductase  34.69 
 
 		 248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1886  Dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  35.32 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  34.32 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  35.21 
 
 		 267 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  34.57 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 		 267 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  33.95 
 
 		 267 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  33.95 
 
 		 267 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  36.87 
 
 		 278 aa  121  8e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  36.99 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  35.75 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  33.59 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  35.87 
 
 		 268 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1424  dihydrodipicolinate reductase  33.58 
 
 		 259 aa  118  9e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  35.87 
 
 		 268 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1170  dihydrodipicolinate reductase  32.32 
 
 		 291 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  37.31 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  35.85 
 
 		 266 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  33.09 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  34.38 
 
 		 270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  37.27 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  37.67 
 
 		 269 aa  116  3e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  36.87 
 
 		 263 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  32.06 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  37.44 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  33.59 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  35.47 
 
 		 284 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0519  dihydrodipicolinate reductase  35.94 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  32.21 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  36.77 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  33.06 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  34.93 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  35.32 
 
 		 267 aa  113  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  35.89 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  35.91 
 
 		 268 aa  113  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1844  dihydrodipicolinate reductase  35.15 
 
 		 264 aa  113  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698201 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  35.68 
 
 		 259 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0553  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 273 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  37.22 
 
 		 268 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  33.04 
 
 		 269 aa  112  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  33.64 
 
 		 271 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  34.55 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  34.09 
 
 		 273 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00035  dihydrodipicolinate reductase  32.88 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0945677  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0070  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  35 
 
 		 263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00034  hypothetical protein  32.88 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0706545  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0590  dihydrodipicolinate reductase  33.93 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1272  dihydrodipicolinate reductase  34.8 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000793767  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0029  dihydrodipicolinate reductase  32.88 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.732281  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3568  Dihydrodipicolinate reductase  32.88 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  35.24 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0033  dihydrodipicolinate reductase  32.88 
 
 		 273 aa  110  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0033  dihydrodipicolinate reductase  32.88 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0841  dihydrodipicolinate reductase  38.12 
 
 		 254 aa  110  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0031  dihydrodipicolinate reductase  32.88 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3624  dihydrodipicolinate reductase  32.88 
 
 		 273 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3842  dihydrodipicolinate reductase  30.86 
 
 		 273 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3649  dihydrodipicolinate reductase  30.86 
 
 		 273 aa  108  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  34.5 
 
 		 263 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0035  dihydrodipicolinate reductase  32.88 
 
 		 273 aa  108  7.000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  30.97 
 
 		 270 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0257  dihydrodipicolinate reductase  34.94 
 
 		 246 aa  108  9.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3460  dihydrodipicolinate reductase  33.94 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.734477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  33.82 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0529  dihydrodipicolinate reductase  31.89 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.687132 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3190  dihydrodipicolinate reductase  34.25 
 
 		 244 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00851874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1414  dihydrodipicolinate reductase  33.92 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0054819  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  32.18 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  32.17 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  31.2 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  31.23 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0966  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 240 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  30.42 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  35.32 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1564  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 268 aa  106  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0069  dihydrodipicolinate reductase  33.82 
 
 		 273 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.364097  normal  0.409733 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  35.81 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2974  dihydrodipicolinate reductase  31.34 
 
 		 265 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  32.67 
 
 		 273 aa  105  5e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>