More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG2002 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG2002  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 238 aa  491  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.180668 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0209  dihydrodipicolinate reductase  52.1 
 
 		 237 aa  261  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00185841  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1812  dihydrodipicolinate reductase  52.1 
 
 		 233 aa  249  4e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2563  dihydrodipicolinate reductase  47.48 
 
 		 239 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.850581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0205  dihydrodipicolinate reductase  50.42 
 
 		 233 aa  238  5e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0244  dihydrodipicolinate reductase  47.33 
 
 		 244 aa  234  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432587 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3529  dihydrodipicolinate reductase  44.9 
 
 		 246 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.703463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2028  dihydrodipicolinate reductase  47.9 
 
 		 238 aa  231  1e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.279033 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07100  dihydrodipicolinate reductase  46.44 
 
 		 238 aa  222  4.9999999999999996e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0304  hypothetical protein  42.44 
 
 		 240 aa  210  2e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.400774 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2492  dihydrodipicolinate reductase  38.91 
 
 		 226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1886  Dihydrodipicolinate reductase  37.25 
 
 		 248 aa  152  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1657  dihydrodipicolinate reductase  36.73 
 
 		 252 aa  152  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2054  Dihydrodipicolinate reductase  36 
 
 		 248 aa  148  8e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00790  dihydrodipicolinate reductase  36.56 
 
 		 269 aa  142  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.610424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0324  dihydrodipicolinate reductase  35.22 
 
 		 248 aa  141  8e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0110233 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2437  Dihydrodipicolinate reductase  35.37 
 
 		 248 aa  141  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2084  Dihydrodipicolinate reductase  35.08 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2095  dihydrodipicolinate reductase  36.95 
 
 		 248 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0519  dihydrodipicolinate reductase  34.63 
 
 		 284 aa  128  8.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.456503  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1170  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1805  dihydrodipicolinate reductase  34.54 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2745  dihydrodipicolinate reductase  34.3 
 
 		 263 aa  118  9e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2984  dihydrodipicolinate reductase  34.78 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2574  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1876  dihydrodipicolinate reductase  31.8 
 
 		 217 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1457  dihydrodipicolinate reductase  32.53 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.46202  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1486  dihydrodipicolinate reductase  32.53 
 
 		 240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4553  dihydrodipicolinate reductase  34.65 
 
 		 284 aa  115  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0966  dihydrodipicolinate reductase  34.14 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2077  dihydrodipicolinate reductase  34.51 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.522648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0355  dihydrodipicolinate reductase  36.54 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.278702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1133  dihydrodipicolinate reductase  31.84 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1970  dihydrodipicolinate reductase  32.6 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.150485  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3270  dihydrodipicolinate reductase  30.3 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0777  dihydrodipicolinate reductase  30.34 
 
 		 267 aa  108  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.486297  hitchhiker  0.000134832 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6007  dihydrodipicolinate reductase  31.9 
 
 		 278 aa  108  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850549 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2809  dihydrodipicolinate reductase  34.16 
 
 		 271 aa  107  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000126202  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1272  dihydrodipicolinate reductase  32.74 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000793767  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2216  dihydrodipicolinate reductase  32.09 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0282245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3922  dihydrodipicolinate reductase  30.4 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1414  dihydrodipicolinate reductase  31.84 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0054819  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02245  dihydrodipicolinate reductase  35.07 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0695174  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0477  dihydrodipicolinate reductase  31.16 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2162  dihydrodipicolinate reductase  31.76 
 
 		 254 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.528738  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2092  dihydrodipicolinate reductase  35.18 
 
 		 259 aa  106  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0962438  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0872  dihydrodipicolinate reductase  29.26 
 
 		 266 aa  106  4e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.11432  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00911  dihydrodipicolinate reductase  33.19 
 
 		 269 aa  106  4e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0835  dihydrodipicolinate reductase  29.44 
 
 		 270 aa  106  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0761651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0525  dihydrodipicolinate reductase  31.01 
 
 		 254 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000702281  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0584  dihydrodipicolinate reductase  34.5 
 
 		 269 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0724522  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0707  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 267 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.165217  hitchhiker  0.00943126 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3087  dihydrodipicolinate reductase  35.15 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.682276  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004481  dihydrodipicolinate reductase  34.06 
 
 		 269 aa  105  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1873  dihydrodipicolinate reductase  31.37 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2730  dihydrodipicolinate reductase  37.1 
 
 		 268 aa  104  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.276845  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4503  dihydrodipicolinate reductase  33.5 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1151  dihydrodipicolinate reductase  30.15 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4591  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 267 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.639045  normal  0.509503 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1397  dihydrodipicolinate reductase  30.83 
 
 		 255 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.219728  normal  0.369495 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2185  dihydrodipicolinate reductase  29.8 
 
 		 251 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3481  dihydrodipicolinate reductase  28.46 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000853274  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4725  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.111929  hitchhiker  0.00253408 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1493  dihydrodipicolinate reductase  31.37 
 
 		 254 aa  103  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.736276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3360  dihydrodipicolinate reductase  30.86 
 
 		 267 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0188921  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1854  dihydrodipicolinate reductase  31.84 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1232  dihydrodipicolinate reductase  32.18 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2456  dihydrodipicolinate reductase  32.18 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.660622  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0373  dihydrodipicolinate reductase  32.18 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3455  dihydrodipicolinate reductase  32.18 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0765  dihydrodipicolinate reductase  34.33 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0122187  normal  0.374891 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1457  dihydrodipicolinate reductase  33.85 
 
 		 252 aa  102  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.585757  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3453  dihydrodipicolinate reductase  32.18 
 
 		 265 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3418  dihydrodipicolinate reductase  32.18 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.550053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2643  dihydrodipicolinate reductase  32.18 
 
 		 268 aa  102  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4193  dihydrodipicolinate reductase  32.02 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0974  Dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 		 267 aa  102  5e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.795296  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0148  dihydrodipicolinate reductase  32.82 
 
 		 263 aa  102  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  35.56 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0512  dihydrodipicolinate reductase  32.06 
 
 		 268 aa  102  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548054 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1150  dihydrodipicolinate reductase  32.67 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0360461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3622  dihydrodipicolinate reductase  32.18 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62940  dihydrodipicolinate reductase  32.34 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0712  dihydrodipicolinate reductase  31.68 
 
 		 273 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.128624 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2505  dihydrodipicolinate reductase  31.25 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.146607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2591  dihydrodipicolinate reductase  31.75 
 
 		 265 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000325383 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1125  dihydrodipicolinate reductase  31.71 
 
 		 267 aa  99.8  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0713267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0572  dihydrodipicolinate reductase  31.6 
 
 		 265 aa  99.8  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260909 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0546  dihydrodipicolinate reductase  30.48 
 
 		 265 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0735119  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5479  dihydrodipicolinate reductase  32.34 
 
 		 268 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3737  dihydrodipicolinate reductase  31.71 
 
 		 265 aa  99  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.221404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2422  dihydrodipicolinate reductase  30.62 
 
 		 267 aa  98.6  7e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000419858  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0073  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 215 aa  98.6  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0408  dihydrodipicolinate reductase  31.07 
 
 		 254 aa  98.6  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0028  dihydrodipicolinate reductase  32.84 
 
 		 278 aa  98.6  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0618  dihydrodipicolinate reductase  31.13 
 
 		 265 aa  98.2  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227402  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42950  dihydrodipicolinate reductase  31.84 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0216  dihydrodipicolinate reductase  29.92 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0035  dihydrodipicolinate reductase  32.08 
 
 		 276 aa  98.2  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4726  dihydrodipicolinate reductase  33.52 
 
 		 267 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.699966  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>