More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3739 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 133 aa  262  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0137  biopolymer transport protein ExbD/TolR  87.97 
 
 		 133 aa  205  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421309  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0269  biopolymer transport protein ExbD, putative  86.47 
 
 		 133 aa  203  8e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0281  transport protein ExbD  73.68 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02510  transport protein ExbD  73.68 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00171764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0220  biopolymer transport protein ExbD/TolR  74.44 
 
 		 133 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.594277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  72.18 
 
 		 133 aa  170  5e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0297  biopolymer transport protein ExbD/TolR  71.43 
 
 		 133 aa  168  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0599369 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2289  biopolymer transport protein ExbD/TolR  70.68 
 
 		 133 aa  166  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115279  decreased coverage  0.0000286842 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21690  Biopolymer transport protein ExbD  68.42 
 
 		 133 aa  159  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08060  Biopolymer transport protein ExbD  68.42 
 
 		 133 aa  159  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21810  Biopolymer transport protein ExbD  68.42 
 
 		 133 aa  159  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0284842  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2483  TonB system transport protein ExbD  68.29 
 
 		 123 aa  144  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316653  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1558  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.61 
 
 		 135 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.125245  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4333  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.14 
 
 		 133 aa  124  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0148  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.89 
 
 		 133 aa  125  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3535  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.58 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0276674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2641  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.14 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3984  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.82 
 
 		 136 aa  120  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357601  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2603  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.58 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.247774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.27 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.798627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  44.36 
 
 		 139 aa  115  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4482  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.15 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.728082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  44.54 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  44.54 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.08 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  42.86 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  44.54 
 
 		 153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  42.96 
 
 		 155 aa  110  5e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  45.11 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.96 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  49.59 
 
 		 157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.91 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.91 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0672  TonB system transport protein ExbD  48.09 
 
 		 134 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678508  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0443  biopolymer ExbD/TolR family transporter  46.88 
 
 		 136 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0670  biopolymer ExbD/TolR family transporter  46.88 
 
 		 136 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.31 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.31 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.31 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.31 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.31 
 
 		 176 aa  104  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.5 
 
 		 147 aa  104  3e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.7 
 
 		 135 aa  104  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  40.83 
 
 		 173 aa  103  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  48.09 
 
 		 156 aa  103  8e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.64 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.06 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  40.5 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  39.5 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  44.54 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  47.2 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  36.97 
 
 		 145 aa  100  7e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.83 
 
 		 155 aa  99.4  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  44.09 
 
 		 144 aa  98.6  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.8 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  38.33 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  39.02 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  39.02 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  39.84 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  36.76 
 
 		 146 aa  98.2  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.57 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.12 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 		 136 aa  97.1  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  39.02 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  39.02 
 
 		 150 aa  97.1  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  40.74 
 
 		 139 aa  96.7  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.67 
 
 		 166 aa  97.1  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.39 
 
 		 136 aa  97.1  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.6 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 		 138 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.12 
 
 		 140 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  38.71 
 
 		 152 aa  95.9  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.58 
 
 		 173 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.67 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  39.67 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.5 
 
 		 156 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  36.8 
 
 		 167 aa  94.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.21 
 
 		 149 aa  94.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.88 
 
 		 140 aa  94.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  38.33 
 
 		 152 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 167 aa  94.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4434  protein TolR  37.5 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0620039  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.69 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  37.12 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5006  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.108407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.69 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.48 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.52 
 
 		 139 aa  93.6  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  38.93 
 
 		 138 aa  93.6  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0813  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.71 
 
 		 136 aa  93.6  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.67 
 
 		 149 aa  93.6  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0971  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.19 
 
 		 137 aa  93.6  9e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.67 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>