More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1114 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
141 aa  288  2e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.62 
 
 
138 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.24 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.1 
 
 
143 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.24 
 
 
142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.24 
 
 
140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.27 
 
 
142 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.49 
 
 
140 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.52 
 
 
140 aa  140  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  51.85 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  51.85 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  51.85 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  51.85 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  51.85 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  51.85 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  51.85 
 
 
142 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  51.85 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  50.74 
 
 
140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.59 
 
 
143 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.85 
 
 
143 aa  136  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  46.67 
 
 
176 aa  136  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  50 
 
 
139 aa  136  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.93 
 
 
158 aa  135  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.55 
 
 
137 aa  135  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.93 
 
 
176 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.93 
 
 
176 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.93 
 
 
176 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.93 
 
 
176 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.59 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.47 
 
 
137 aa  130  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.079959  normal  0.0276297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.79 
 
 
138 aa  130  6e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.93 
 
 
153 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1965  biopolymer transport transmembrane protein  52.21 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.36 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2237  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.47 
 
 
137 aa  126  9.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1047  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.47 
 
 
139 aa  126  9.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.32 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 
139 aa  124  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1794  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.68 
 
 
136 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 
151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 
151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 
151 aa  124  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1210  biopolymer ExbD/TolR family transporter  46.1 
 
 
178 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.72 
 
 
136 aa  124  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.06 
 
 
136 aa  124  5e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 
140 aa  124  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.32 
 
 
136 aa  124  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2118  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.94 
 
 
136 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0526178  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3451  ExbD/TolR family transport energizing protein  47.01 
 
 
176 aa  123  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3416  ExbD/TolR family transport energizing protein  47.01 
 
 
172 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.83 
 
 
139 aa  120  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0878  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.22 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0295235  normal  0.0766117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1022  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.22 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0335138  normal  0.0307792 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 
152 aa  116  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.85 
 
 
136 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.65 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0383  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.63 
 
 
141 aa  115  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0787741 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 
151 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.340528 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0912  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.47 
 
 
139 aa  114  6e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1936  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.03 
 
 
142 aa  114  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.22 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.32 
 
 
140 aa  110  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.43 
 
 
146 aa  110  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.71 
 
 
141 aa  110  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4624  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.93 
 
 
137 aa  110  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000994253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.06 
 
 
135 aa  110  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.83 
 
 
140 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5006  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.67 
 
 
140 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.108407 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1715  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.67 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1147  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.04 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6363  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.67 
 
 
140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0283531  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  39.71 
 
 
145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1730  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.67 
 
 
140 aa  108  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245052  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0010  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
141 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041719 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  42.06 
 
 
141 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2090  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.17 
 
 
144 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0249583  normal  0.766976 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  44.44 
 
 
143 aa  105  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.5 
 
 
133 aa  104  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  42.14 
 
 
139 aa  103  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  42.86 
 
 
143 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  42.86 
 
 
143 aa  103  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  42.86 
 
 
143 aa  103  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.76 
 
 
140 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.76 
 
 
140 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0011  biopolymer transport ExbD1 protein  41.04 
 
 
139 aa  101  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.62 
 
 
141 aa  101  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3232  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.35 
 
 
146 aa  100  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.15 
 
 
139 aa  100  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0751  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.86 
 
 
107 aa  99.8  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  41.46 
 
 
155 aa  99.8  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.65 
 
 
173 aa  99.8  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  40.98 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1443  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.68 
 
 
142 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  40.48 
 
 
142 aa  98.6  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.68 
 
 
142 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970491  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  41.32 
 
 
140 aa  98.6  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0011  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.04 
 
 
136 aa  99.4  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.01 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>