More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1249 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 133 aa  266  8.999999999999999e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  63.16 
 
 		 133 aa  181  4.0000000000000006e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.65 
 
 		 133 aa  177  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.9 
 
 		 133 aa  168  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.91 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.15 
 
 		 158 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.3 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.54 
 
 		 139 aa  107  6e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.3 
 
 		 138 aa  105  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.48 
 
 		 139 aa  105  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  38.81 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  38.81 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  38.81 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  38.81 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  38.81 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  38.81 
 
 		 142 aa  105  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 137 aa  104  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.26 
 
 		 176 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.26 
 
 		 176 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.26 
 
 		 176 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.5 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.26 
 
 		 176 aa  104  4e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 		 142 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  38.06 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.35 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.26 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.94 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  38.58 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.22 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.27 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  40 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.5 
 
 		 143 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.6 
 
 		 136 aa  99.4  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0600  hypothetical protein  85.45 
 
 		 56 aa  98.6  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.811202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1210  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40.74 
 
 		 178 aa  97.8  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  35.34 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3451  ExbD/TolR family transport energizing protein  40.74 
 
 		 176 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141094  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.24 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.84 
 
 		 140 aa  96.7  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3416  ExbD/TolR family transport energizing protein  40 
 
 		 172 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0383  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.24 
 
 		 141 aa  96.7  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0787741 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.04 
 
 		 135 aa  94.7  4e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.04 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1730  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.33 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245052  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.04 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.94 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.35 
 
 		 136 aa  93.6  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 151 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.8 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1715  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.72 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6363  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0283531  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.7 
 
 		 137 aa  92.8  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.079959  normal  0.0276297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5006  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.81 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.108407 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.8 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  39.67 
 
 		 173 aa  91.3  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  37.19 
 
 		 151 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  37.19 
 
 		 151 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  39.52 
 
 		 167 aa  87.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2237  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.55 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  38.71 
 
 		 145 aa  87.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.38 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3233  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.4 
 
 		 151 aa  87.4  7e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0878  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.67 
 
 		 141 aa  86.7  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0295235  normal  0.0766117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1022  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.67 
 
 		 141 aa  86.7  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0335138  normal  0.0307792 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.37 
 
 		 140 aa  86.7  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  36.67 
 
 		 149 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.71 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.02 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1965  biopolymer transport transmembrane protein  39.55 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.6 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1119  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.51 
 
 		 144 aa  85.5  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  35.83 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  35 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0012  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.3 
 
 		 136 aa  84.7  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.511922  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0012  biopolymer transport ExbD2 protein  36.3 
 
 		 136 aa  84.7  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3389  protein TolR  38.84 
 
 		 145 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436196  normal  0.250194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  34.71 
 
 		 153 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  34.17 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  34.17 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1756  biopolymer transport ExbD protein  35.66 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1344  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.34 
 
 		 144 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0746  protein TolR  38.84 
 
 		 148 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  33.88 
 
 		 153 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  33.88 
 
 		 153 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1147  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.34 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>