More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A3739 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 152 aa  299  9e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  94.12 
 
 		 153 aa  257  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  97.06 
 
 		 151 aa  250  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  96.32 
 
 		 151 aa  248  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  96.32 
 
 		 151 aa  248  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  96.32 
 
 		 151 aa  248  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  95.59 
 
 		 151 aa  233  9e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  71.83 
 
 		 143 aa  206  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  76.3 
 
 		 176 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  76.3 
 
 		 176 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  76.3 
 
 		 176 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  76.3 
 
 		 176 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  75.56 
 
 		 176 aa  203  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  71.11 
 
 		 158 aa  201  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  69.72 
 
 		 143 aa  200  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1210  biopolymer ExbD/TolR family transporter  77.04 
 
 		 178 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3416  ExbD/TolR family transport energizing protein  77.04 
 
 		 172 aa  187  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3451  ExbD/TolR family transport energizing protein  77.78 
 
 		 176 aa  187  5e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141094  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.73 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.85 
 
 		 138 aa  137  7e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.76 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.7 
 
 		 137 aa  131  3e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.93 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.65 
 
 		 146 aa  131  3e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 		 141 aa  130  5e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.93 
 
 		 136 aa  129  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.76 
 
 		 142 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.76 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.76 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.59 
 
 		 143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  49.59 
 
 		 142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  49.59 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  49.59 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  49.59 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  49.59 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  49.59 
 
 		 142 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  49.59 
 
 		 140 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  49.63 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.56 
 
 		 140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  49.59 
 
 		 142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.19 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.93 
 
 		 140 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.93 
 
 		 136 aa  123  7e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.93 
 
 		 136 aa  123  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.93 
 
 		 142 aa  123  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  48.33 
 
 		 139 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.8 
 
 		 133 aa  120  6e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3787  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.88 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  41.13 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0878  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.18 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0295235  normal  0.0766117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1022  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.18 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0335138  normal  0.0307792 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  48.87 
 
 		 145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4606  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.52 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.15 
 
 		 140 aa  117  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1756  biopolymer transport ExbD protein  44.6 
 
 		 143 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2237  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.15 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.63 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.079959  normal  0.0276297 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0011  biopolymer transport ExbD1 protein  41.18 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1119  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.03 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1965  biopolymer transport transmembrane protein  49.63 
 
 		 137 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.93 
 
 		 135 aa  114  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1047  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.37 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3268  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.59 
 
 		 146 aa  114  6e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03474  biopolymer transport ExbD1 protein  43.44 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3920  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.59 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.5 
 
 		 133 aa  111  3e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.96 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.27 
 
 		 156 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0011  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0410  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1794  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0010  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.88 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041719 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.72 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2118  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0526178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0757  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.36 
 
 		 142 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.8 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4498  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.08 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0912  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.63 
 
 		 139 aa  107  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.84 
 
 		 140 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1715  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1147  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.27 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6363  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 		 140 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0283531  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.37 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.72 
 
 		 162 aa  105  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5006  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.01 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.108407 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1730  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 		 140 aa  105  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245052  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  42.36 
 
 		 167 aa  104  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0383  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.58 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0787741 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  41.54 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.01 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.43 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  38.24 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4624  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.22 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000994253 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  39.67 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.7 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4354  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.44 
 
 		 143 aa  102  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>