More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0410 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0410  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 156 aa  310  5.999999999999999e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3787  biopolymer transport protein ExbD/TolR  63.85 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4606  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.14 
 
 		 142 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  52.21 
 
 		 145 aa  142  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0757  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.19 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  53.66 
 
 		 176 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  53.66 
 
 		 176 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  53.66 
 
 		 176 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  53.66 
 
 		 176 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.82 
 
 		 158 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  52.85 
 
 		 176 aa  135  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.28 
 
 		 153 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3920  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.82 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3268  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.82 
 
 		 146 aa  133  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.99 
 
 		 146 aa  130  9e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 143 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1210  biopolymer ExbD/TolR family transporter  53.49 
 
 		 178 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.1 
 
 		 151 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.28 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.28 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.32 
 
 		 138 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.46 
 
 		 151 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.54 
 
 		 143 aa  123  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3451  ExbD/TolR family transport energizing protein  54.47 
 
 		 176 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3416  ExbD/TolR family transport energizing protein  54.47 
 
 		 172 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 		 152 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.47 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.1 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  44.52 
 
 		 167 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  42.96 
 
 		 155 aa  117  7e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.4 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.78 
 
 		 136 aa  115  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  43.41 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  42.54 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.55 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.53 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  42.34 
 
 		 143 aa  112  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.74 
 
 		 142 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4551  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.66 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  43.09 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.62 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  41.94 
 
 		 142 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  44.36 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.13 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  41.13 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  41.13 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.13 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  42.54 
 
 		 139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.13 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.13 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.13 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.67 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.74 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.09 
 
 		 136 aa  107  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  40.67 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.94 
 
 		 140 aa  107  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.89 
 
 		 155 aa  107  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  40.48 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.45 
 
 		 154 aa  106  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6005  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.782622 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  40.16 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  39.06 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  38.99 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.85 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.31 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  40.3 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  40.3 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.75 
 
 		 151 aa  103  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.26 
 
 		 173 aa  103  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 139 aa  103  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.35 
 
 		 140 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.19 
 
 		 137 aa  103  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.079959  normal  0.0276297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0922  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.8 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.219154 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  38.97 
 
 		 148 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.84 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0878  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.97 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0295235  normal  0.0766117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1022  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.97 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0335138  normal  0.0307792 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  40.98 
 
 		 158 aa  102  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.32 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.32 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.09 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  39.67 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.69 
 
 		 147 aa  101  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.62 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  40.65 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  40.65 
 
 		 151 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.13 
 
 		 139 aa  101  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.13 
 
 		 139 aa  100  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  35 
 
 		 152 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  40.94 
 
 		 140 aa  100  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0272  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 149 aa  100  6e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.512888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1147  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.1 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03474  biopolymer transport ExbD1 protein  42.62 
 
 		 129 aa  100  7e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 		 151 aa  100  9e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  40.91 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>