More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0653 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
151 aa  293  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
151 aa  293  7e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  98.68 
 
 
151 aa  290  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  98.68 
 
 
151 aa  290  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  98.01 
 
 
151 aa  288  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.340528 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  92.65 
 
 
153 aa  254  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  94.56 
 
 
152 aa  237  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  72.34 
 
 
143 aa  205  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  76.3 
 
 
176 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  76.3 
 
 
176 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  76.3 
 
 
176 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  76.3 
 
 
176 aa  204  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  75.56 
 
 
176 aa  203  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  71.85 
 
 
158 aa  203  6e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  70.92 
 
 
143 aa  200  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3451  ExbD/TolR family transport energizing protein  77.78 
 
 
176 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141094  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1210  biopolymer ExbD/TolR family transporter  77.04 
 
 
178 aa  189  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3416  ExbD/TolR family transport energizing protein  77.04 
 
 
172 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.73 
 
 
138 aa  155  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.24 
 
 
138 aa  136  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.93 
 
 
139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.7 
 
 
137 aa  130  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 
141 aa  130  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.32 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.65 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.19 
 
 
136 aa  128  3e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.33 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.33 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.59 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.33 
 
 
140 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  49.63 
 
 
140 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  49.59 
 
 
142 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  49.59 
 
 
142 aa  126  9.000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  49.59 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  49.59 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  49.59 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  49.59 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.56 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  49.59 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  49.59 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.19 
 
 
137 aa  125  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.93 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.93 
 
 
142 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.93 
 
 
136 aa  122  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.93 
 
 
136 aa  122  2e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  46.58 
 
 
145 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  48.33 
 
 
139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3787  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.88 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0878  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.18 
 
 
141 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0295235  normal  0.0766117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1022  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.18 
 
 
141 aa  118  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0335138  normal  0.0307792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4606  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.86 
 
 
142 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 
139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.41 
 
 
136 aa  117  7e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 
133 aa  117  7e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0011  biopolymer transport ExbD1 protein  41.18 
 
 
139 aa  117  7.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.15 
 
 
140 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.63 
 
 
137 aa  116  7.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.079959  normal  0.0276297 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2237  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.15 
 
 
137 aa  116  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1119  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.73 
 
 
144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1965  biopolymer transport transmembrane protein  49.63 
 
 
137 aa  114  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  40.32 
 
 
133 aa  114  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3268  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.15 
 
 
146 aa  114  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1756  biopolymer transport ExbD protein  43.88 
 
 
143 aa  114  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03474  biopolymer transport ExbD1 protein  43.44 
 
 
129 aa  113  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 
135 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3920  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.15 
 
 
146 aa  113  8.999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1047  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.63 
 
 
139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0011  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0410  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.28 
 
 
156 aa  111  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.823092  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 
141 aa  110  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.7 
 
 
136 aa  110  5e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.67 
 
 
133 aa  110  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1794  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 
136 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2118  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 
136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0526178  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0010  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.88 
 
 
141 aa  110  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041719 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0912  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50.37 
 
 
139 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.37 
 
 
140 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4498  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.08 
 
 
141 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  43.66 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44 
 
 
140 aa  106  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1715  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.8 
 
 
140 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.53 
 
 
156 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 
133 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6363  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.8 
 
 
140 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0283531  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.37 
 
 
140 aa  104  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 
139 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.72 
 
 
141 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1730  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 
140 aa  104  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245052  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5006  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.01 
 
 
140 aa  104  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.108407 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0757  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.28 
 
 
142 aa  104  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0383  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.58 
 
 
141 aa  104  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0787741 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2367  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.97 
 
 
162 aa  104  5e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4624  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.96 
 
 
137 aa  103  7e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000994253 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1147  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.13 
 
 
140 aa  103  7e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3233  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.52 
 
 
142 aa  103  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  40.46 
 
 
147 aa  103  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4354  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 
143 aa  103  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.43 
 
 
140 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.7 
 
 
141 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.43 
 
 
140 aa  101  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>