More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0011 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0011  biopolymer transport ExbD1 protein  100 
 
 
139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0011  biopolymer transport protein ExbD/TolR  97.12 
 
 
136 aa  269  9e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0010  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  74.1 
 
 
141 aa  213  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041719 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03474  biopolymer transport ExbD1 protein  79.53 
 
 
129 aa  209  1e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.38 
 
 
138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.67 
 
 
142 aa  120  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  40.91 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40.91 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  40.91 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40.91 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  40.91 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  40.91 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.64 
 
 
140 aa  118  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.65 
 
 
153 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.93 
 
 
142 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.64 
 
 
140 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.64 
 
 
140 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.64 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.64 
 
 
142 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  39.69 
 
 
139 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.59 
 
 
136 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.12 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.12 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  39.39 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.65 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  43.38 
 
 
140 aa  114  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.3 
 
 
158 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.98 
 
 
143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.13 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 
151 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.73 
 
 
136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40.44 
 
 
176 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40.44 
 
 
176 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.71 
 
 
143 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40.44 
 
 
176 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40.44 
 
 
176 aa  110  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0012  biopolymer transport ExbD2 protein  43.28 
 
 
136 aa  110  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0012  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.28 
 
 
136 aa  110  8.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.511922  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.28 
 
 
135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.97 
 
 
143 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  41.3 
 
 
176 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.35 
 
 
139 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.46 
 
 
139 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4624  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.29 
 
 
137 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000994253 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0011  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.96 
 
 
137 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423536 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0383  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.31 
 
 
141 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0787741 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.35 
 
 
139 aa  104  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.98 
 
 
140 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.69 
 
 
139 aa  104  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.06 
 
 
139 aa  103  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 
151 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.340528 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3416  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.18 
 
 
172 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 
136 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3451  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.18 
 
 
176 aa  102  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141094  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.98 
 
 
137 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2237  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.44 
 
 
137 aa  101  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1210  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40.44 
 
 
178 aa  101  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.04 
 
 
141 aa  101  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.44 
 
 
137 aa  100  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.079959  normal  0.0276297 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 
152 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.76 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  39.52 
 
 
147 aa  98.6  3e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.4 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.22 
 
 
141 aa  98.2  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.24 
 
 
140 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.35 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0440021  normal  0.632014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.52 
 
 
146 aa  96.7  8e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0878  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0295235  normal  0.0766117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1022  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.86 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0335138  normal  0.0307792 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.24 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1715  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.57 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.52 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6363  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.57 
 
 
140 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0283531  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1730  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.09 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245052  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5006  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.07 
 
 
140 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.108407 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3233  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.14 
 
 
142 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.04 
 
 
140 aa  93.6  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  34.68 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.78 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.218457 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0912  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.91 
 
 
139 aa  92  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4354  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.17 
 
 
143 aa  92  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 
140 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  39.57 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.7 
 
 
141 aa  90.1  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1965  biopolymer transport transmembrane protein  41.04 
 
 
137 aa  90.1  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.84 
 
 
149 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.88 
 
 
156 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1756  biopolymer transport ExbD protein  36.23 
 
 
143 aa  88.6  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0281  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.149561  hitchhiker  0.000106063 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3412  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.04 
 
 
135 aa  88.2  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.544248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  35.94 
 
 
151 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  35.94 
 
 
151 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  38.17 
 
 
152 aa  87.8  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.09 
 
 
133 aa  86.3  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.52 
 
 
147 aa  86.3  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  34.78 
 
 
167 aa  86.3  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.29 
 
 
166 aa  86.7  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>