More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3412 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3412  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
135 aa  265  1e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.544248 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0011  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.52 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00423536 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0012  biopolymer transport ExbD2 protein  51.82 
 
 
136 aa  123  7e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0012  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.82 
 
 
136 aa  123  7e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.511922  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03473  biopolymer transport ExbD2 protein  51.56 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 
158 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.01 
 
 
143 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.52 
 
 
153 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1573  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.43 
 
 
139 aa  97.8  4e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.320463 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.01 
 
 
143 aa  97.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.03 
 
 
138 aa  97.8  5e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  43.17 
 
 
176 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  43.17 
 
 
176 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  43.17 
 
 
176 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  43.17 
 
 
176 aa  94.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 
151 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  42.45 
 
 
176 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.88 
 
 
151 aa  92.8  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.88 
 
 
151 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.88 
 
 
151 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.35 
 
 
141 aa  89.4  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.59 
 
 
137 aa  89  2e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0011  biopolymer transport ExbD1 protein  37.04 
 
 
139 aa  88.2  4e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.71 
 
 
136 aa  87.8  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.71 
 
 
136 aa  88.2  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0011  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.04 
 
 
136 aa  87.4  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.61 
 
 
138 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.15 
 
 
137 aa  87  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.84 
 
 
140 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.23 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.09 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.84 
 
 
142 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.82 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  36.09 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.09 
 
 
140 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.34 
 
 
151 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.340528 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  36.09 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.09 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  36.09 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  36.09 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.09 
 
 
142 aa  84.7  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  36.09 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1147  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  40.15 
 
 
140 aa  84  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3416  ExbD/TolR family transport energizing protein  39.57 
 
 
172 aa  84.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.37 
 
 
152 aa  84  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0010  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.96 
 
 
141 aa  84  6e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041719 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.26 
 
 
140 aa  84  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3451  ExbD/TolR family transport energizing protein  38.85 
 
 
176 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141094  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.52 
 
 
139 aa  83.6  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1210  biopolymer ExbD/TolR family transporter  42.45 
 
 
178 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.4 
 
 
143 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  34.09 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0120  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.3 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0436048  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4624  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.3 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000994253 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  33.09 
 
 
133 aa  82  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.59 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.59 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0878  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.74 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0295235  normal  0.0766117 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1022  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.74 
 
 
141 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0335138  normal  0.0307792 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.59 
 
 
140 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3233  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.97 
 
 
142 aa  80.1  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0383  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.9 
 
 
141 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0787741 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.83 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0014  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.51 
 
 
146 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2090  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.15 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0249583  normal  0.766976 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.71 
 
 
135 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.1 
 
 
146 aa  77  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1936  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.09 
 
 
142 aa  76.6  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1119  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.88 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0805  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.85 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251807 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  29.46 
 
 
136 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.1 
 
 
141 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.87 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03474  biopolymer transport ExbD1 protein  37.9 
 
 
129 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.78 
 
 
136 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
156 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1344  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.34 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.56 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0813  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.06 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.06 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.84 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1965  biopolymer transport transmembrane protein  39.26 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.87 
 
 
151 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 
140 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  33.85 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.218457 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.16 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  34.65 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.52 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1756  biopolymer transport ExbD protein  35.48 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5006  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.108407 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 
140 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>