More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0813 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_0813  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
136 aa  272  1.0000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1756  biopolymer transport ExbD protein  66.67 
 
 
143 aa  188  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1119  biopolymer transport protein ExbD/TolR  63.31 
 
 
144 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  62.96 
 
 
139 aa  176  9e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.218457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.54 
 
 
141 aa  155  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2089  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.21 
 
 
141 aa  145  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0440021  normal  0.632014 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4354  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.24 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  53.28 
 
 
141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3233  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.41 
 
 
142 aa  142  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.94 
 
 
140 aa  137  7e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.55 
 
 
141 aa  135  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.21 
 
 
140 aa  135  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  50 
 
 
140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.12 
 
 
140 aa  134  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0383  biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.64 
 
 
141 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0787741 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5006  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.53 
 
 
140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.108407 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1715  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.53 
 
 
140 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6363  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.53 
 
 
140 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0283531  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1730  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.53 
 
 
140 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245052  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.65 
 
 
142 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  44.93 
 
 
142 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  44.93 
 
 
142 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  44.93 
 
 
142 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  44.93 
 
 
142 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  44.93 
 
 
142 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  44.93 
 
 
142 aa  122  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  44.12 
 
 
140 aa  119  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.2 
 
 
137 aa  118  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.93 
 
 
136 aa  116  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.67 
 
 
136 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  42.34 
 
 
139 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.6 
 
 
142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.12 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.12 
 
 
136 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.17 
 
 
142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.53 
 
 
140 aa  114  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.15 
 
 
136 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.48 
 
 
137 aa  113  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.07 
 
 
140 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.8 
 
 
140 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.8 
 
 
140 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.88 
 
 
143 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.34 
 
 
139 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.17 
 
 
138 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  47.24 
 
 
137 aa  106  8.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.079959  normal  0.0276297 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.83 
 
 
138 aa  105  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1965  biopolymer transport transmembrane protein  44.44 
 
 
137 aa  105  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2237  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.03 
 
 
137 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.85 
 
 
135 aa  104  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0711  putative biopolymer transport protein  38.46 
 
 
140 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0310861 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.97 
 
 
176 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.34 
 
 
139 aa  102  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.97 
 
 
176 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2477  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.51 
 
 
140 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0883915  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.97 
 
 
176 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.97 
 
 
176 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 
133 aa  100  5e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0806  biopolymer transport ExbD protein  37.8 
 
 
173 aa  100  6e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00274891 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.82 
 
 
153 aa  100  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.13 
 
 
176 aa  100  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0119  biopolymer transport-like protein  42.76 
 
 
160 aa  99.4  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0532523  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4624  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.34 
 
 
137 aa  99  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000994253 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0812  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.26 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 
133 aa  97.4  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.83 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.66 
 
 
156 aa  94.4  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.07 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0805  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.6 
 
 
141 aa  94  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251807 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.97 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.97 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 
139 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.97 
 
 
151 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.09 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.61 
 
 
158 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1936  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.88 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.02 
 
 
166 aa  91.7  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.03 
 
 
142 aa  91.7  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1794  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.7 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2090  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.69 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0249583  normal  0.766976 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  38.97 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1210  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.71 
 
 
178 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2118  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.7 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0526178  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.17 
 
 
143 aa  90.1  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.29 
 
 
151 aa  89.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.340528 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3451  ExbD/TolR family transport energizing protein  35.29 
 
 
176 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.141094  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.5 
 
 
139 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3416  ExbD/TolR family transport energizing protein  35.29 
 
 
172 aa  89.4  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  37.6 
 
 
143 aa  88.2  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0751  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 
107 aa  87.8  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.784453 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.85 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  35.66 
 
 
139 aa  87  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3232  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.07 
 
 
146 aa  86.3  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2154  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.52 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.8914  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1443  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.3 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1757  biopolymer transport ExbD protein  37.9 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.289345 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.84 
 
 
150 aa  84.7  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.3 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.970491  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0384  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.03 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.127436 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0725  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.92 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154388  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>