More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0225 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 136 aa  273  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.798627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1558  biopolymer transport protein ExbD/TolR  59.26 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.125245  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3535  biopolymer transport protein ExbD/TolR  62.12 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0276674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3984  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.36 
 
 		 136 aa  136  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357601  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2603  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.36 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.247774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0297  biopolymer transport protein ExbD/TolR  59.85 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0599369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  59.09 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21690  Biopolymer transport protein ExbD  58.33 
 
 		 133 aa  123  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21810  Biopolymer transport protein ExbD  58.33 
 
 		 133 aa  123  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0284842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08060  Biopolymer transport protein ExbD  58.33 
 
 		 133 aa  123  9e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2289  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.58 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115279  decreased coverage  0.0000286842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0220  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.58 
 
 		 133 aa  121  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.594277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0281  transport protein ExbD  56.82 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02510  transport protein ExbD  56.82 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00171764  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0269  biopolymer transport protein ExbD, putative  52.27 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2483  TonB system transport protein ExbD  57.85 
 
 		 123 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316653  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4482  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.24 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.728082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.27 
 
 		 133 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0137  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.52 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.11 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0443  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.86 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0670  biopolymer ExbD/TolR family transporter  45.86 
 
 		 136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  42.11 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  42.65 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0672  TonB system transport protein ExbD  50 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678508  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  41.18 
 
 		 139 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  39.68 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  39.68 
 
 		 153 aa  105  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  38.19 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  40.16 
 
 		 153 aa  104  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  37.5 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  37.5 
 
 		 150 aa  103  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.03 
 
 		 152 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0661  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.58 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0695  protein TolR  40.58 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0696  protein TolR  40.58 
 
 		 150 aa  103  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  38.41 
 
 		 146 aa  102  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  39.01 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  40.98 
 
 		 156 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2641  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.48 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.76 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.76 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.34 
 
 		 147 aa  100  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  38.71 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  38.71 
 
 		 151 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  41.32 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  40.16 
 
 		 173 aa  99.4  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1531  hypothetical protein  36.96 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1452  hypothetical protein  36.96 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  43.9 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  41.61 
 
 		 176 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  40.98 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  41.61 
 
 		 176 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  41.61 
 
 		 176 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  41.61 
 
 		 176 aa  98.6  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.5 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  36.09 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4333  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.24 
 
 		 133 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737829  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.04 
 
 		 133 aa  97.4  5e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  37.5 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0148  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  49.24 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.71 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  37.6 
 
 		 152 aa  97.1  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 151 aa  96.7  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40.88 
 
 		 176 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.55 
 
 		 152 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.220249 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 151 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1965  biopolymer transport transmembrane protein  42.96 
 
 		 137 aa  95.5  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.2 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1532  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 151 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0594  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.85 
 
 		 143 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  40 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.23 
 
 		 139 aa  94.7  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.33 
 
 		 149 aa  95.1  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.83 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.8 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1762  protein TolR  38.35 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.69 
 
 		 154 aa  94.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0412  TolR  38.35 
 
 		 147 aa  94.4  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.127174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  39.02 
 
 		 155 aa  94.4  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.24 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  36.76 
 
 		 139 aa  94  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  39.52 
 
 		 134 aa  93.6  8e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.41 
 
 		 143 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  40.32 
 
 		 167 aa  93.6  8e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0574  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.98 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.340528 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.76 
 
 		 137 aa  93.2  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  36.29 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6111  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.66 
 
 		 140 aa  93.6  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.58 
 
 		 140 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.69 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2629  biopolymer transport TolR  37.5 
 
 		 149 aa  92.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0612  ExbD/TolR family protein  37.69 
 
 		 143 aa  92  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.34 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.218457 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0813  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.85 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>