More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1558 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007947  Mfla_1558  biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 
135 aa  266  8.999999999999999e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.125245  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2603  biopolymer transport protein ExbD/TolR  64.39 
 
 
136 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.247774  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  59.26 
 
 
136 aa  141  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.798627  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3535  biopolymer transport protein ExbD/TolR  63.64 
 
 
136 aa  140  4e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0276674  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3984  biopolymer transport protein ExbD/TolR  62.88 
 
 
136 aa  138  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357601  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21810  Biopolymer transport protein ExbD  60.61 
 
 
133 aa  130  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0284842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08060  Biopolymer transport protein ExbD  60.61 
 
 
133 aa  130  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21690  Biopolymer transport protein ExbD  60.61 
 
 
133 aa  130  6e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02510  transport protein ExbD  61.36 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00171764  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0281  transport protein ExbD  61.36 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0220  biopolymer transport protein ExbD/TolR  61.36 
 
 
133 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.594277  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2289  biopolymer transport protein ExbD/TolR  59.09 
 
 
133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115279  decreased coverage  0.0000286842 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0137  biopolymer transport protein ExbD/TolR  59.09 
 
 
133 aa  124  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421309  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  60.61 
 
 
133 aa  124  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  59.09 
 
 
133 aa  125  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4482  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.99 
 
 
134 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.728082  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0269  biopolymer transport protein ExbD, putative  57.58 
 
 
133 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0297  biopolymer transport protein ExbD/TolR  58.33 
 
 
133 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0599369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0672  TonB system transport protein ExbD  52.24 
 
 
134 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678508  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.22 
 
 
137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2641  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.13 
 
 
133 aa  114  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0443  biopolymer ExbD/TolR family transporter  44.85 
 
 
136 aa  111  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0670  biopolymer ExbD/TolR family transporter  44.85 
 
 
136 aa  111  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.54 
 
 
136 aa  111  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2483  TonB system transport protein ExbD  57.02 
 
 
123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316653  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4333  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.88 
 
 
133 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0148  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.13 
 
 
133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  44.53 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.79 
 
 
136 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.79 
 
 
136 aa  106  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  41.61 
 
 
142 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.61 
 
 
142 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  41.61 
 
 
142 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.61 
 
 
142 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  41.94 
 
 
138 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.61 
 
 
142 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  41.61 
 
 
142 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2279  biopolymer transport protein ExbD/TolR  46.32 
 
 
137 aa  104  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.079959  normal  0.0276297 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.18 
 
 
144 aa  103  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.65 
 
 
139 aa  103  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1965  biopolymer transport transmembrane protein  45.19 
 
 
137 aa  103  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.393052 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.62 
 
 
141 aa  103  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  41.91 
 
 
139 aa  103  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  41.18 
 
 
139 aa  103  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.22 
 
 
136 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  40.88 
 
 
142 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  40.94 
 
 
140 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.55 
 
 
141 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  41.46 
 
 
173 aa  101  4e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.07 
 
 
135 aa  101  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.84 
 
 
166 aa  100  5e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 
142 aa  100  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.61 
 
 
142 aa  100  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.15 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.04 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.85 
 
 
136 aa  99.4  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.78 
 
 
133 aa  99.8  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1512  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 
133 aa  98.6  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.77 
 
 
140 aa  98.6  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.48 
 
 
140 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  45.53 
 
 
155 aa  99.4  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.48 
 
 
140 aa  98.6  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  39.52 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.48 
 
 
140 aa  98.6  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0586  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.97 
 
 
136 aa  98.2  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0531481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  45.08 
 
 
156 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  38.73 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  38.73 
 
 
153 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  40.77 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  38.81 
 
 
176 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  38.81 
 
 
176 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.2 
 
 
151 aa  97.8  5e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.56 
 
 
137 aa  97.4  5e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  38.81 
 
 
176 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  38.81 
 
 
176 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.4 
 
 
151 aa  97.4  6e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  38.71 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  38.71 
 
 
150 aa  97.1  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  38.81 
 
 
176 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.71 
 
 
158 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.34 
 
 
133 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0705  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.76 
 
 
152 aa  96.3  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.105618  normal  0.350278 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.23 
 
 
139 aa  95.9  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.81 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1052  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 
156 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2237  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.38 
 
 
137 aa  95.5  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  38.03 
 
 
153 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  38.13 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1794  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.07 
 
 
136 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0946301  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1730  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.89 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.245052  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  43.7 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1407  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.53 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.757544  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1076  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.46 
 
 
143 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.24 
 
 
138 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4624  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.7 
 
 
137 aa  94.7  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000994253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  34.88 
 
 
167 aa  94.4  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.71 
 
 
140 aa  94.4  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.24 
 
 
138 aa  94.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2118  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.34 
 
 
136 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0526178  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>