More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2641 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2641  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  100 
 
 		 133 aa  260  4e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4333  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  78.2 
 
 		 133 aa  173  6e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0148  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  76.69 
 
 		 133 aa  170  5.999999999999999e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21690  Biopolymer transport protein ExbD  60.9 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21810  Biopolymer transport protein ExbD  60.9 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0284842  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08060  Biopolymer transport protein ExbD  60.9 
 
 		 133 aa  132  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0220  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.89 
 
 		 133 aa  129  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.594277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2289  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.25 
 
 		 133 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115279  decreased coverage  0.0000286842 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0281  transport protein ExbD  56.39 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02510  transport protein ExbD  56.39 
 
 		 133 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00171764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.64 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1558  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.13 
 
 		 135 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.125245  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.14 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0297  biopolymer transport protein ExbD/TolR  54.14 
 
 		 133 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0599369 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0269  biopolymer transport protein ExbD, putative  52.63 
 
 		 133 aa  120  8e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0137  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.63 
 
 		 133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4482  biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.13 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.728082  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0672  TonB system transport protein ExbD  51.13 
 
 		 134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678508  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3984  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.27 
 
 		 136 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357601  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3535  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.27 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0276674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2483  TonB system transport protein ExbD  56.1 
 
 		 123 aa  110  6e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316653  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  42.86 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  42.11 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2603  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.27 
 
 		 136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.247774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  42.11 
 
 		 153 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.48 
 
 		 136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.798627  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0443  biopolymer ExbD/TolR family transporter  49.21 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0670  biopolymer ExbD/TolR family transporter  49.21 
 
 		 136 aa  106  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1756  biopolymer transport ExbD protein  41.09 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  40 
 
 		 139 aa  100  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.06 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.35 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.11 
 
 		 140 aa  98.6  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  39.26 
 
 		 139 aa  98.6  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.04 
 
 		 139 aa  98.6  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.11 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3381  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.57 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113024 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.31 
 
 		 176 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.31 
 
 		 176 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.31 
 
 		 176 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.31 
 
 		 176 aa  97.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  40.34 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  37.31 
 
 		 176 aa  97.1  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.66 
 
 		 166 aa  95.9  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  39.67 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  41.67 
 
 		 173 aa  95.9  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1904  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 		 133 aa  95.1  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.358326  normal  0.205106 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1662  iopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00365164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.06 
 
 		 151 aa  93.6  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  38.89 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2589  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.84 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382062  hitchhiker  0.000000237185 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  35.88 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  42.02 
 
 		 157 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0620  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 151 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4694  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.4 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0653  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.763594  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3520  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127703  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0170  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 151 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 		 140 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  37.5 
 
 		 152 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.82 
 
 		 144 aa  90.9  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1908  ExbD/TolR family protein  36.36 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0575  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.58 
 
 		 143 aa  90.5  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.523101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.06 
 
 		 139 aa  90.5  6e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  41.18 
 
 		 156 aa  90.5  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.59 
 
 		 140 aa  90.5  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0135  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.72 
 
 		 156 aa  90.5  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  36.36 
 
 		 150 aa  90.5  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3173  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 149 aa  90.1  9e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.673251  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.82 
 
 		 140 aa  90.1  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3203  protein TolR  36.59 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.349327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 		 139 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3498  protein TolR  36.59 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.13 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  38.24 
 
 		 155 aa  89.7  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  35.04 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  35.54 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3239  tolR protein  40.15 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.16 
 
 		 151 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  35.54 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.06 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.85 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0330  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.6 
 
 		 173 aa  88.2  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.175992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1249  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.52 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.368012 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2215  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.72 
 
 		 154 aa  87.4  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  33.85 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.218457 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  31.3 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  36.09 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.01 
 
 		 140 aa  87  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.11 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1015  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.65 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.228328  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.59 
 
 		 149 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.58 
 
 		 137 aa  86.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0470  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.77 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.923665 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.36 
 
 		 136 aa  86.3  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>