More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0269 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0269  biopolymer transport protein ExbD, putative  100 
 
 		 133 aa  264  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0137  biopolymer transport protein ExbD/TolR  98.5 
 
 		 133 aa  261  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3739  biopolymer transport protein ExbD/TolR  86.47 
 
 		 133 aa  202  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0220  biopolymer transport protein ExbD/TolR  72.18 
 
 		 133 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.594277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02510  transport protein ExbD  72.18 
 
 		 133 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00171764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0281  transport protein ExbD  72.18 
 
 		 133 aa  168  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2289  biopolymer transport protein ExbD/TolR  69.17 
 
 		 133 aa  163  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115279  decreased coverage  0.0000286842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0297  biopolymer transport protein ExbD/TolR  68.42 
 
 		 133 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0599369 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  66.92 
 
 		 133 aa  159  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21690  Biopolymer transport protein ExbD  66.92 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08060  Biopolymer transport protein ExbD  66.92 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21810  Biopolymer transport protein ExbD  66.92 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0284842  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2483  TonB system transport protein ExbD  69.92 
 
 		 123 aa  147  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316653  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1558  biopolymer transport protein ExbD/TolR  57.58 
 
 		 135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.125245  hitchhiker  0.000666739 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.27 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.798627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3535  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.39 
 
 		 136 aa  120  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0276674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3984  biopolymer transport protein ExbD/TolR  55.64 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357601  normal  0.130758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2603  biopolymer transport protein ExbD/TolR  56.39 
 
 		 136 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.247774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2641  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  52.63 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3074  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.7 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00262954  normal  0.170197 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4333  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.13 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.737829  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2408  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.18 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.692692  normal  0.803966 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1440  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.18 
 
 		 136 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0148  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  51.13 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3511  protein TolR  44.36 
 
 		 139 aa  114  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0114553  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4482  biopolymer transport protein ExbD/TolR  48.09 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.728082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1805  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.67 
 
 		 137 aa  110  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3580  protein TolR  41.35 
 
 		 139 aa  107  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3313  biopolymer transport protein ExbD/TolR  45.59 
 
 		 135 aa  106  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.93238  normal  0.758523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0672  TonB system transport protein ExbD  45.8 
 
 		 134 aa  105  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678508  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0527  protein TolR  42.65 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.35 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0856  protein TolR  46.67 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1619  protein TolR  42.02 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.1444  normal  0.157176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1617  protein TolR  41.18 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.776263  hitchhiker  0.0037279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1899  protein TolR  41.18 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.937922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1213  protein TolR  38.66 
 
 		 147 aa  103  5e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2641  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.76 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0443  biopolymer ExbD/TolR family transporter  44.53 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.102103  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0670  biopolymer ExbD/TolR family transporter  44.53 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.198674  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2454  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.76 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1114  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.809728  normal  0.285485 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1230  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.76 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0371  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.76 
 
 		 176 aa  102  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3453  biopolymer ExbD/TolR family transporter  36.03 
 
 		 176 aa  101  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0506  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.529067  hitchhiker  0.000695312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1396  protein TolR  44.27 
 
 		 156 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.60771  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  44.17 
 
 		 139 aa  100  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2901  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.34 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00149833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2200  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1143  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.31 
 
 		 137 aa  98.6  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3136  protein TolR  36.76 
 
 		 146 aa  98.6  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0219  putative transport-related membrane protein  35.04 
 
 		 145 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.748949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2570  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.67 
 
 		 136 aa  99.4  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00988954  hitchhiker  0.000963498 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5877  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.46 
 
 		 140 aa  99  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1442  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.69 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0573  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.85 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.234389  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1756  biopolymer transport ExbD protein  42.52 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.439399 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0840  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0352738 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0391  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.84 
 
 		 159 aa  95.5  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2998  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.84 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2733  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.5 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2118  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.92 
 
 		 142 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.64 
 
 		 136 aa  94.7  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  39.2 
 
 		 173 aa  94.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1947  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.69 
 
 		 139 aa  94.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.81805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0689  biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.59 
 
 		 140 aa  93.6  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.828997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4624  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.85 
 
 		 137 aa  93.6  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000994253 
 
 
-
 
NC_004310  BR1699  ExbD/TolR family TonB system transport protein  40.5 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0813  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.89 
 
 		 136 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.5 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0863  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.09 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0638904  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1641  protein TolR  40.5 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436956  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3121  protein TolR  43.2 
 
 		 142 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2363  protein TolR  40 
 
 		 139 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372464 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2977  TolR protein  41.73 
 
 		 144 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3416  ExbD/TolR family transport energizing protein  33.82 
 
 		 172 aa  92  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0520  ExbD/TolR family transport energizing protein  34.62 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3142  biopolymer transport transmembrane protein, ExbD/TolR like  37.21 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.421775  normal  0.0460891 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1216  biopolymer transport TolR  39.67 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212808  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3619  protein TolR  40.83 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1803  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.62 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.831218  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2064  ExbD/TolR family transport energizing protein  34.62 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0997  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.82 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.975721 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1930  biopolymer ExbD/TolR family transporter  34.62 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.880013 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1092  ExbD/TolR family transport energizing protein  34.62 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0617  ExbD/TolR family transport energizing protein  34.62 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3720  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.15 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.334783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1109  biopolymer transport TolR  37.19 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00176605  normal  0.311844 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0800  ExbD/TolR family transport energizing protein  34.62 
 
 		 140 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3166  protein TolR  40.34 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0548  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.76 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268527  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2145  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.17 
 
 		 167 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0478  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.96 
 
 		 146 aa  90.5  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0150  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36 
 
 		 149 aa  90.1  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000194485  hitchhiker  0.00605756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>