51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0805 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0805  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 295 aa  620  1e-177  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  33.73 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0880  glycoside hydrolase family protein  27.21 
 
 		 333 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395386  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.34 
 
 		 1290 aa  62.8  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0843  glycoside hydrolase family protein  28.17 
 
 		 284 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146434  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  27.02 
 
 		 409 aa  60.1  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  26.94 
 
 		 383 aa  59.3  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  26.61 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2435  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.02 
 
 		 252 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.744797  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  25.45 
 
 		 883 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.32 
 
 		 633 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0824  glycoside hydrolase family protein  24.14 
 
 		 454 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000871412  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  21.51 
 
 		 642 aa  55.1  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  21.51 
 
 		 641 aa  54.7  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.7 
 
 		 912 aa  54.3  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  28.77 
 
 		 1321 aa  52.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  27.96 
 
 		 819 aa  52.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.88 
 
 		 532 aa  51.2  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.66 
 
 		 627 aa  51.6  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  24.81 
 
 		 1694 aa  50.4  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4792  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 		 608 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  23.53 
 
 		 467 aa  50.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4667  glycoside hydrolase family 16  26.89 
 
 		 275 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  24.78 
 
 		 389 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  25.08 
 
 		 346 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0724  beta-glucanase/beta-glucan synthetase-like protein  24.88 
 
 		 295 aa  49.7  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.882839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  25.89 
 
 		 1332 aa  48.9  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  24.28 
 
 		 291 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  26.15 
 
 		 261 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  26.24 
 
 		 1918 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4552  glycoside hydrolase family protein  26.7 
 
 		 686 aa  48.9  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.4064 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  24.57 
 
 		 427 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0247  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.303741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3131  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.826615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  26.02 
 
 		 274 aa  47  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6224  endo-1,3-1,4-beta-glycanase, C-terminal secretion signal protein  24.86 
 
 		 475 aa  46.6  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380521  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_89444  predicted protein  24 
 
 		 477 aa  45.8  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0724789  hitchhiker  0.00296553 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  25.6 
 
 		 907 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0724  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.25 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.337879 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  23.2 
 
 		 1028 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4533  glycoside hydrolase family protein  24.45 
 
 		 306 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.04 
 
 		 884 aa  45.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2605  glycoside hydrolase family protein  29.17 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.838168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  27.57 
 
 		 569 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  25 
 
 		 465 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  26.61 
 
 		 286 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  23.48 
 
 		 358 aa  43.5  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 		 556 aa  42.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0875  glycoside hydrolase family 16  26.34 
 
 		 313 aa  42.7  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  25.53 
 
 		 694 aa  42.7  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  25.26 
 
 		 1059 aa  42.4  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>