31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0843 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0843  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 284 aa  589  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146434  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0880  glycoside hydrolase family protein  26.46 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395386  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0824  glycoside hydrolase family protein  28.45 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000871412  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  27.36 
 
 		 274 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0805  glycoside hydrolase family protein  28.17 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  26.8 
 
 		 503 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  27.17 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  28.35 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2108  glycoside hydrolase family 16  28.63 
 
 		 319 aa  53.9  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.369089 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  28.11 
 
 		 556 aa  53.9  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2578  glycoside hydrolase family protein  29.87 
 
 		 277 aa  52.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  25.97 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6294  glycoside hydrolase family protein  26.47 
 
 		 427 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.202957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  27.5 
 
 		 883 aa  52.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2825  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 		 492 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  26.89 
 
 		 409 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0211  glycoside hydrolase family protein  31.21 
 
 		 334 aa  50.4  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00263756  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6737  glycoside hydrolase family 16  26.25 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.833986  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4793  glycoside hydrolase family protein  25.45 
 
 		 320 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3542  glycoside hydrolase family 16  33.33 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4931  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 		 465 aa  48.1  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.533696 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  30 
 
 		 394 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  26.92 
 
 		 588 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  27.84 
 
 		 289 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4802  glycoside hydrolase family protein  26.82 
 
 		 907 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.609138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  27.45 
 
 		 330 aa  43.9  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  23.85 
 
 		 383 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1119  endo-beta-galactosidase, GlcNAc-alpha-1,4-Gal-releasing  24.15 
 
 		 420 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.308798  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1175  agarase  27.97 
 
 		 598 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000232044  unclonable  0.000000011081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3548  glycoside hydrolase family 16  25.14 
 
 		 486 aa  42.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0863  glycoside hydrolase family 16  27.61 
 
 		 842 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>