More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0271 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_02911  two-component sensor histidine kinase  91.01 
 
 		 378 aa  702    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.144075  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0271  two-component sensor histidine kinase  100 
 
 		 378 aa  763    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02921  two-component sensor histidine kinase  90.21 
 
 		 378 aa  696    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03021  two-component sensor histidine kinase  74.8 
 
 		 378 aa  591  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.505956  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1635  two-component sensor histidine kinase  45.22 
 
 		 373 aa  301  1e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03481  two-component sensor histidine kinase  44.64 
 
 		 373 aa  296  4e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24881  two-component sensor histidine kinase  40 
 
 		 379 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02961  two-component sensor histidine kinase  40.05 
 
 		 376 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0240  histidine kinase  38.73 
 
 		 373 aa  256  3e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0269  histidine kinase  36.84 
 
 		 374 aa  235  9e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0453  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.6 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2691  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 442 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3068  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.55142  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3053  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 434 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1719  histidine kinase  26.27 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3912  histidine kinase  28.2 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879371  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2733  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 458 aa  73.2  0.000000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650304  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2640  histidine kinase  27.8 
 
 		 397 aa  70.9  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.976353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 902 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  27.64 
 
 		 497 aa  70.5  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.76 
 
 		 433 aa  70.1  0.00000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.47 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210303  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 445 aa  68.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.02 
 
 		 701 aa  67  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2115  histidine kinase  25.87 
 
 		 379 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4169  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 302 aa  66.6  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  25.58 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 		 905 aa  66.6  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  24.4 
 
 		 885 aa  65.9  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  25.12 
 
 		 471 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  22.59 
 
 		 363 aa  66.2  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  21.18 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.16 
 
 		 1181 aa  65.1  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1606  sensor histidine kinase  20.96 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.22 
 
 		 478 aa  64.3  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.18 
 
 		 680 aa  64.3  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 1568 aa  64.3  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1908  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.92 
 
 		 487 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218614  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3223  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.139517 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 511 aa  63.9  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4387  sensor histidine kinase  25.79 
 
 		 500 aa  64.3  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0595  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.72 
 
 		 752 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03966  two-component system sensor protein  24.9 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.27 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0884  histidine kinase  28.4 
 
 		 454 aa  63.5  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.456358  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0364  sensor histidine kinase SaeS  26.92 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 1042 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2675  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.11 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.441961 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.38 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.067404 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  23.53 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4607  histidine kinase  24.4 
 
 		 696 aa  63.2  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.998833  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  24.64 
 
 		 542 aa  63.2  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0219  histidine kinase  26.17 
 
 		 1166 aa  62.8  0.000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.803779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  24.19 
 
 		 1152 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  26.14 
 
 		 1327 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2285  histidine kinase  23.53 
 
 		 510 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000343872  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.23 
 
 		 907 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 456 aa  62  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1347  sensor protein PhoQ  24.57 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  26.64 
 
 		 495 aa  62  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1954  sensor protein PhoQ  24.57 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1331  sensor protein PhoQ  24.57 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0246748  normal  0.298422 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1898  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 546 aa  61.6  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1359  histidine kinase  25.52 
 
 		 469 aa  61.6  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2136  sensor protein PhoQ  24.57 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.062219 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1309  sensor protein PhoQ  24.57 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.591966 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 		 596 aa  60.8  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1617  histidine kinase  22.94 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  22.71 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  23.42 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1611  ATPase domain-containing protein  31.37 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.584949  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3806  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 533 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.576691  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1616  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 587 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  22.71 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  22.71 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  25.68 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  22.71 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0263  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  22.71 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  22.71 
 
 		 501 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1642  sensor protein PhoQ  26.52 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1216  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.24 
 
 		 357 aa  60.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  28.87 
 
 		 464 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  25.32 
 
 		 539 aa  60.5  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20731  hypothetical protein  37.8 
 
 		 140 aa  60.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  23.36 
 
 		 535 aa  60.5  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2103  histidine kinase  24.83 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0592  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 		 1113 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0114606 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 		 452 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  19.92 
 
 		 387 aa  60.1  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9847  two component sensor kinase  25.48 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>