More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_03481 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_1635  two-component sensor histidine kinase  98.12 
 
 
373 aa  736    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03481  two-component sensor histidine kinase  100 
 
 
373 aa  754    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169774  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02961  two-component sensor histidine kinase  58.42 
 
 
376 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24881  two-component sensor histidine kinase  53.78 
 
 
379 aa  380  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0240  histidine kinase  44.38 
 
 
373 aa  323  2e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02911  two-component sensor histidine kinase  44.89 
 
 
378 aa  311  9e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.144075  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0271  two-component sensor histidine kinase  44.6 
 
 
378 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02921  two-component sensor histidine kinase  45.11 
 
 
378 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03021  two-component sensor histidine kinase  42.82 
 
 
378 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.505956  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0269  histidine kinase  43.37 
 
 
374 aa  286  5.999999999999999e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0453  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
404 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2691  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
442 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3053  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
434 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2733  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.19 
 
 
458 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650304  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3068  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 
434 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.55142  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1719  histidine kinase  26.29 
 
 
454 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
445 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3912  histidine kinase  24.7 
 
 
462 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879371  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
531 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  27.95 
 
 
526 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
465 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  28.19 
 
 
467 aa  79  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210303  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.02 
 
 
902 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 
907 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  29.52 
 
 
556 aa  76.6  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  28.45 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  28.45 
 
 
471 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  29.28 
 
 
480 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  28.39 
 
 
496 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.07 
 
 
513 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1331  adaptive-response sensory kinase  24.42 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234976 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1303  adaptive-response sensory kinase  24.42 
 
 
391 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
464 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.95 
 
 
464 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3416  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
456 aa  73.6  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.61 
 
 
524 aa  73.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 
462 aa  73.6  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  26.94 
 
 
484 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  26.94 
 
 
484 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 
678 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
457 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.097715  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1908  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.89 
 
 
487 aa  72.4  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218614  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3960  histidine kinase  28.05 
 
 
473 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.432188  normal  0.191507 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1313  sensor protein  28.15 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.00000254318  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  28.76 
 
 
481 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1532  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 
469 aa  72  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1373  sensor protein qseC  28.15 
 
 
478 aa  71.6  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000622972  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0468  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
596 aa  71.2  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
493 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3229  histidine kinase  27.12 
 
 
557 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3790  sensor histidine kinase  29.2 
 
 
475 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2709  sensor histidine kinase  29.2 
 
 
475 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
457 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
478 aa  71.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5322  histidine kinase sensor  23.49 
 
 
529 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.968492 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02448  predicted sensory kinase in two-component system  29.2 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1112  histidine kinase  29.2 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.660046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2709  sensor histidine kinase  29.2 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  24.51 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02412  hypothetical protein  29.2 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 
486 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.17 
 
 
900 aa  70.5  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2841  sensor histidine kinase  29.2 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  23.31 
 
 
902 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
475 aa  70.5  0.00000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.31 
 
 
395 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 
511 aa  70.5  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 
510 aa  70.1  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0250  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.18 
 
 
541 aa  70.1  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  28.19 
 
 
473 aa  70.1  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
359 aa  70.1  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
515 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0977  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 
379 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
530 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5356  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
377 aa  69.7  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.940445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  25.63 
 
 
515 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2755  sensor protein qseC  25.91 
 
 
454 aa  70.1  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276799  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2921  sensor histidine kinase  29.2 
 
 
475 aa  69.7  0.00000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
413 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.22 
 
 
509 aa  69.3  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 
476 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  23.9 
 
 
472 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1061  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 
459 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  26.75 
 
 
561 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
1177 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1359  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.5 
 
 
452 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.166082  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  23 
 
 
905 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2957  sensor histidine kinase  43.18 
 
 
506 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.882031  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0305  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 
754 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  26.05 
 
 
517 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
902 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  23.25 
 
 
401 aa  68.6  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.18 
 
 
515 aa  68.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283678  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4931  sensory box histidine kinase  23.45 
 
 
617 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  27.4 
 
 
504 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0498  histidine kinase  25.1 
 
 
487 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>