More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_03021 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008817  P9515_03021  two-component sensor histidine kinase  100 
 
 
378 aa  756    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.505956  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0271  two-component sensor histidine kinase  74.8 
 
 
378 aa  591  1e-168  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02911  two-component sensor histidine kinase  75.33 
 
 
378 aa  589  1e-167  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.144075  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02921  two-component sensor histidine kinase  74.54 
 
 
378 aa  582  1.0000000000000001e-165  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24881  two-component sensor histidine kinase  38.38 
 
 
379 aa  287  2.9999999999999996e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1635  two-component sensor histidine kinase  42.66 
 
 
373 aa  282  7.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03481  two-component sensor histidine kinase  42.47 
 
 
373 aa  280  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169774  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02961  two-component sensor histidine kinase  37.4 
 
 
376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0240  histidine kinase  36.8 
 
 
373 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0269  histidine kinase  36.07 
 
 
374 aa  236  6e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0453  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 
404 aa  102  1e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2691  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.22 
 
 
442 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3068  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
434 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.55142  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3053  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
434 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
445 aa  81.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1719  histidine kinase  25.39 
 
 
454 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1908  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 
487 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0218614  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  26.67 
 
 
471 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  25.57 
 
 
439 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2733  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 
458 aa  73.6  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650304  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 
701 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
437 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210303  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1586  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1611  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
442 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
530 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.104669  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 
511 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 
510 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 
902 aa  69.7  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0943  histidine kinase  28.4 
 
 
530 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.215183  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 
433 aa  68.9  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1607  sensor protein PhoQ  29.49 
 
 
484 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2856  sensor protein PhoQ  29.49 
 
 
484 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3912  histidine kinase  24.6 
 
 
462 aa  68.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879371  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1714  sensor protein PhoQ  29.49 
 
 
468 aa  68.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  24.12 
 
 
885 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0364  sensor histidine kinase SaeS  27.39 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  26.15 
 
 
332 aa  67  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1938  sensor protein PhoQ  29.06 
 
 
483 aa  67  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2709  sensor histidine kinase  26.7 
 
 
475 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3790  sensor histidine kinase  26.7 
 
 
475 aa  67  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2921  sensor histidine kinase  26.24 
 
 
475 aa  66.2  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.83 
 
 
905 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2640  histidine kinase  28.57 
 
 
397 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.976353  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 
478 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2150  sensor protein PhoQ  29.11 
 
 
486 aa  65.5  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0666594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2067  sensor protein PhoQ  29.24 
 
 
483 aa  65.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.194184  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02448  predicted sensory kinase in two-component system  26.24 
 
 
475 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1112  histidine kinase  26.24 
 
 
460 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.660046  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  22.22 
 
 
363 aa  65.1  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02412  hypothetical protein  26.24 
 
 
475 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2709  sensor histidine kinase  26.24 
 
 
475 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
476 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
902 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1121  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.24 
 
 
475 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.79 
 
 
463 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0729  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  24.83 
 
 
905 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2841  sensor histidine kinase  26.24 
 
 
460 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4318  ATPase domain-containing protein  25.27 
 
 
593 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.819924  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0745  ATPase domain-containing protein  30.92 
 
 
351 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  20.79 
 
 
463 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.05 
 
 
905 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  25.63 
 
 
508 aa  64.3  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3584  histidine kinase  25.69 
 
 
495 aa  63.9  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
367 aa  63.5  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
474 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
474 aa  63.9  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
484 aa  63.5  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  24.67 
 
 
458 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  31.18 
 
 
474 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2570  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
515 aa  63.5  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.283678  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2957  sensor histidine kinase  30.63 
 
 
506 aa  63.5  0.000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.882031  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  24.67 
 
 
458 aa  63.5  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 
600 aa  63.5  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3053  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.18 
 
 
679 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3180  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.49 
 
 
455 aa  62.4  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  24.67 
 
 
458 aa  62.4  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3447  ATP-binding region ATPase domain protein  24.8 
 
 
278 aa  62.4  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
477 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 
958 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2352  histidine kinase  30 
 
 
387 aa  62  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  26.32 
 
 
501 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  26.32 
 
 
501 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  22.66 
 
 
472 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.16 
 
 
479 aa  62  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.292807  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  26.32 
 
 
501 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  30.77 
 
 
472 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2012  sensor protein PhoQ  29.41 
 
 
485 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0783662 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  25 
 
 
458 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  26.32 
 
 
501 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1865  sensor protein PhoQ  28.57 
 
 
484 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  26.32 
 
 
501 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
501 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1826  histidine kinase  27.03 
 
 
828 aa  61.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.881555  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
421 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  33.33 
 
 
476 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  25.73 
 
 
476 aa  61.2  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  32.32 
 
 
504 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0091  histidine kinase  24.22 
 
 
386 aa  60.8  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>