More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_02961 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_02961  two-component sensor histidine kinase  100 
 
 
376 aa  759    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1635  two-component sensor histidine kinase  58.22 
 
 
373 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24881  two-component sensor histidine kinase  57.57 
 
 
379 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03481  two-component sensor histidine kinase  57.95 
 
 
373 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169774  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0240  histidine kinase  46.42 
 
 
373 aa  318  1e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0269  histidine kinase  46.81 
 
 
374 aa  294  2e-78  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0271  two-component sensor histidine kinase  40.05 
 
 
378 aa  288  1e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02921  two-component sensor histidine kinase  39.52 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02911  two-component sensor histidine kinase  38.62 
 
 
378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.144075  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03021  two-component sensor histidine kinase  37.4 
 
 
378 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.505956  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0453  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
404 aa  135  8e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2691  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 
442 aa  107  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3068  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
434 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.55142  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3053  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 
434 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2733  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.66 
 
 
458 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650304  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1719  histidine kinase  28.29 
 
 
454 aa  84  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  30.17 
 
 
496 aa  83.6  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.69 
 
 
680 aa  83.6  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  27.07 
 
 
464 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  27.78 
 
 
397 aa  80.9  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
637 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0305  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
754 aa  80.1  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
478 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1331  adaptive-response sensory kinase  28.03 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00234976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3171  adaptive-response sensory kinase  28.62 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.109214 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1303  adaptive-response sensory kinase  28.03 
 
 
391 aa  79.7  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0074  histidine kinase  27.24 
 
 
492 aa  79.7  0.00000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
515 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  24.31 
 
 
387 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 
455 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2634  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.79 
 
 
451 aa  78.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0932991  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0023  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.91 
 
 
455 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 
394 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.88 
 
 
463 aa  77.8  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0050  histidine kinase  23.83 
 
 
455 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
544 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0039  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 
455 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3251  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.35487  normal  0.0265543 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0031  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 
455 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
511 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 
477 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
387 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
517 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  26.4 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0074  histidine kinase  26.56 
 
 
493 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.376042  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5356  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.940445 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2936  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 
379 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 
437 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210303  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2317  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.24 
 
 
524 aa  74.7  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2720  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
1171 aa  75.1  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  27.31 
 
 
467 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
515 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.21 
 
 
515 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
519 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.21 
 
 
510 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.05 
 
 
464 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 
1118 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
884 aa  73.6  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  28.76 
 
 
584 aa  73.6  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3957  histidine kinase  26.95 
 
 
466 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25.88 
 
 
1274 aa  72.8  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  25.4 
 
 
464 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 
902 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  26.64 
 
 
539 aa  72.8  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
465 aa  72.8  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.9 
 
 
462 aa  72.8  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
468 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2173  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
457 aa  72.4  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.097715  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 
478 aa  72.4  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0088  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 
359 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
474 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
474 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  23.85 
 
 
549 aa  72.8  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0250  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 
541 aa  72.8  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 
600 aa  72  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
464 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
448 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0429  ATP-binding region ATPase domain protein  26.05 
 
 
568 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.796172  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  28.14 
 
 
517 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  25.56 
 
 
617 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  27.83 
 
 
517 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 
902 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 
365 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
678 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.28 
 
 
1138 aa  70.9  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 
448 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.067404 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
524 aa  70.9  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
517 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4037  histidine kinase  26.29 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  28.77 
 
 
508 aa  70.9  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 
517 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  28.57 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  26.96 
 
 
817 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>