More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0269 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0269  histidine kinase  100 
 
 		 374 aa  744    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0240  histidine kinase  66.31 
 
 		 373 aa  488  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24881  two-component sensor histidine kinase  51.58 
 
 		 379 aa  346  3e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02961  two-component sensor histidine kinase  46.81 
 
 		 376 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1635  two-component sensor histidine kinase  43.09 
 
 		 373 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03481  two-component sensor histidine kinase  43.37 
 
 		 373 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02911  two-component sensor histidine kinase  37.34 
 
 		 378 aa  258  2e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.144075  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02921  two-component sensor histidine kinase  37.43 
 
 		 378 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0271  two-component sensor histidine kinase  36.84 
 
 		 378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03021  two-component sensor histidine kinase  36.07 
 
 		 378 aa  255  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.505956  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0453  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 		 404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2691  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 442 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 478 aa  96.7  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3068  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 434 aa  94  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.55142  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3053  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 		 434 aa  93.6  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  30.96 
 
 		 472 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 467 aa  83.6  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  27.84 
 
 		 466 aa  83.2  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  32.07 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20811  Signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 496 aa  82.4  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.861206 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3125  histidine kinase  31.05 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000442668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1719  histidine kinase  29.44 
 
 		 454 aa  80.1  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 452 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 455 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 396 aa  80.1  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 437 aa  79.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210303  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4843  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 		 484 aa  79.3  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.173911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2733  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650304  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 509 aa  78.2  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3912  histidine kinase  24.31 
 
 		 462 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1938  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 462 aa  77  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  26.69 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1397  ATP-binding region ATPase domain protein  28.77 
 
 		 498 aa  76.3  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4999  putative sensor histidine kinase  24.32 
 
 		 337 aa  76.3  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.938877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 455 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0315  putative sensor histidine kinase  38 
 
 		 204 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 484 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427807  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  38.54 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 		 477 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  28.11 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0272  sensor histidine kinase  38.54 
 
 		 340 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  38.54 
 
 		 340 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  38.54 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0286  sensor histidine kinase  25 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 464 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32710  signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 526 aa  75.1  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.714085  normal  0.582506 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1611  ATPase domain-containing protein  29.93 
 
 		 452 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.584949  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4520  ATPase domain-containing protein  28.57 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320419  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0050  histidine kinase  27.65 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 450 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 464 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 395 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5391  histidine kinase  28.67 
 
 		 542 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7563  histidine kinase  29.23 
 
 		 389 aa  74.3  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3333  histidine kinase  30.91 
 
 		 468 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  27.38 
 
 		 478 aa  73.9  0.000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4300  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 515 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 		 365 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 515 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.702832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  29.61 
 
 		 476 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3436  sensor histidine kinase  34.4 
 
 		 497 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.999938  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  28.82 
 
 		 517 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0039  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4680  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.17 
 
 		 515 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0784763 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0031  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 455 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 637 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  29.49 
 
 		 439 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  27.98 
 
 		 347 aa  73.2  0.000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 474 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  27.78 
 
 		 475 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7402  histidine kinase  26.64 
 
 		 524 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.13845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 474 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 469 aa  72.4  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 475 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383004  normal  0.0334865 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2926  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 887 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.77 
 
 		 1162 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1268  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 887 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 		 385 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1156  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 526 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.331298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2486  histidine kinase  29.84 
 
 		 347 aa  72  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 468 aa  72  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1599  ATPase domain-containing protein  28.78 
 
 		 453 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2866  histidine kinase  29.26 
 
 		 508 aa  72  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.147951 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  28.7 
 
 		 427 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1598  histidine kinase  30.68 
 
 		 487 aa  71.6  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4709  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 504 aa  71.6  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  23.66 
 
 		 489 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1742  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 608 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 522 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  27.62 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2201  multisensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 633 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1376  histidine kinase  28.78 
 
 		 481 aa  71.2  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.331507  decreased coverage  0.00000000423782 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>