More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0240 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0240  histidine kinase  100 
 
 		 373 aa  739    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0269  histidine kinase  66.49 
 
 		 374 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24881  two-component sensor histidine kinase  50.4 
 
 		 379 aa  344  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1635  two-component sensor histidine kinase  43.84 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03481  two-component sensor histidine kinase  44.11 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02961  two-component sensor histidine kinase  46.42 
 
 		 376 aa  318  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02911  two-component sensor histidine kinase  37.83 
 
 		 378 aa  263  4e-69  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.144075  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02921  two-component sensor histidine kinase  37.7 
 
 		 378 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0271  two-component sensor histidine kinase  38.73 
 
 		 378 aa  256  3e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03021  two-component sensor histidine kinase  36.8 
 
 		 378 aa  249  5e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.505956  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0453  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 404 aa  139  8.999999999999999e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2691  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 442 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3053  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 434 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3068  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.55142  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1719  histidine kinase  31.06 
 
 		 454 aa  90.5  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 437 aa  90.1  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210303  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 478 aa  80.1  0.00000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 452 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2733  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650304  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3912  histidine kinase  26.65 
 
 		 462 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2664  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 445 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0527  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 477 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2537  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 445 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.246285  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  30.77 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0050  histidine kinase  31.48 
 
 		 455 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 460 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0039  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0031  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 455 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20811  Signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 496 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.861206 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 462 aa  74.7  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5948  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 448 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.304417 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  30.17 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0892  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 902 aa  73.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  31.16 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3295  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 		 465 aa  73.9  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 448 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 367 aa  73.6  0.000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 523 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1717  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 447 aa  73.6  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.873938  normal  0.15988 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  30.84 
 
 		 505 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  28.57 
 
 		 471 aa  73.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  30.2 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3106  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 450 aa  73.2  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.119049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 		 543 aa  73.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0903  histidine kinase  29.49 
 
 		 472 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.442245  normal  0.275605 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2646  histidine kinase  32.73 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2007  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2617  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 448 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4371  histidine kinase  28.74 
 
 		 589 aa  72.8  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.948741 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.5 
 
 		 509 aa  72.8  0.000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 484 aa  72.4  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.427807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.34 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  31.22 
 
 		 363 aa  72  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  24.75 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  27.2 
 
 		 332 aa  72.8  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3841  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 474 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0681  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 448 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.953793  normal  0.661096 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  30.49 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  25.51 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  30.09 
 
 		 817 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6174  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.436599 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  29.33 
 
 		 517 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0497  histidine kinase  37.5 
 
 		 464 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.623662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 474 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  30.4 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 515 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3964  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.415671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4682  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457019  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3681  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.716633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 518 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  25.09 
 
 		 463 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  34.92 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 		 365 aa  70.5  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2429  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 		 474 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3168  sensory transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 460 aa  70.5  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0023  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.28 
 
 		 455 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0604  sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2438  sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0309  sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0052  sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1010  sensor kinase protein  32.77 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0851  sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 438 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2950  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.32891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2906  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0846  sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 438 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.63 
 
 		 515 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 378 aa  69.7  0.00000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3103  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.79 
 
 		 522 aa  69.7  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 		 457 aa  69.7  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>