More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3912 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3912  histidine kinase  100 
 
 		 462 aa  945    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1719  histidine kinase  44.44 
 
 		 454 aa  338  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2733  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 		 458 aa  322  9.999999999999999e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2691  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 		 442 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.19 
 
 		 437 aa  292  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.210303  normal  0.186163 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3053  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3068  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 434 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.55142  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0453  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.51 
 
 		 566 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 582 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.01 
 
 		 489 aa  97.8  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0924  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 664 aa  95.9  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1524  Signal transduction histidine kinase  27.82 
 
 		 517 aa  95.9  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.13171  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05451  two-component sensor histidine kinase  25.47 
 
 		 685 aa  95.5  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 585 aa  95.5  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 581 aa  94.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 815 aa  94  5e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1358  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 		 896 aa  94  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.942872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3790  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 		 689 aa  94  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.296529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  29.43 
 
 		 587 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 587 aa  94  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  29.43 
 
 		 587 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0244  histidine kinase  29.41 
 
 		 391 aa  93.2  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.300489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 469 aa  92.8  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3303  histidine kinase  25.68 
 
 		 356 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000380955 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3368  histidine kinase  26.64 
 
 		 434 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.383223  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  28.68 
 
 		 587 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  28.68 
 
 		 587 aa  90.9  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  28.68 
 
 		 587 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  28.68 
 
 		 587 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  28.68 
 
 		 587 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 463 aa  90.1  7e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3573  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 		 650 aa  90.1  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 359 aa  90.1  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  28.68 
 
 		 587 aa  90.1  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 585 aa  90.1  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4262  histidine kinase  29.45 
 
 		 436 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0130026 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 608 aa  89.4  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0240  histidine kinase  26.65 
 
 		 373 aa  89  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4223  histidine kinase  29.45 
 
 		 436 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3767  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 		 587 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 563 aa  88.6  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 		 458 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  26.22 
 
 		 650 aa  89  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.18 
 
 		 637 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 		 519 aa  88.6  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 467 aa  88.2  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 444 aa  88.2  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 631 aa  88.2  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  27.92 
 
 		 587 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 460 aa  87.4  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 599 aa  87.8  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1635  two-component sensor histidine kinase  24.25 
 
 		 373 aa  87.4  5e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.65 
 
 		 468 aa  87.4  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 413 aa  87.4  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  26.1 
 
 		 527 aa  87.4  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 		 592 aa  87  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3493  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 		 867 aa  87  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.789076  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0490  histidine kinase  28.14 
 
 		 364 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.184842  normal  0.399326 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0476  histidine kinase  28.14 
 
 		 364 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 		 488 aa  86.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 438 aa  86.3  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  27.03 
 
 		 466 aa  85.9  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0713  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.61 
 
 		 867 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.14 
 
 		 590 aa  85.9  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1993  sensor histidine kinase  26.95 
 
 		 253 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.237870000000001e-44 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 		 592 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 695 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  25.81 
 
 		 902 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  28.14 
 
 		 537 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.79 
 
 		 587 aa  85.9  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 880 aa  85.1  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0550  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 		 696 aa  85.5  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.472328  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  27.55 
 
 		 617 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1421  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 		 483 aa  85.5  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  24.84 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  25.78 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4723  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  25.08 
 
 		 670 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  25.78 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0510  Cache sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 633 aa  84.7  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4132  histidine kinase  27.84 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.544187 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  26.86 
 
 		 496 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  25.37 
 
 		 352 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 604 aa  84.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 718 aa  84.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.46 
 
 		 3470 aa  84.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0493  histidine kinase  33.57 
 
 		 467 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 		 897 aa  84.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0175  histidine kinase  29.13 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  25.39 
 
 		 351 aa  84  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  25.74 
 
 		 581 aa  84.3  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4093  histidine kinase  27.45 
 
 		 471 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1773  sensor histidine kinase  25.78 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13951  two-component sensor histidine kinase  25.76 
 
 		 686 aa  83.6  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0290244  normal  0.899353 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 		 581 aa  83.6  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 607 aa  83.6  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>