More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1616 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1616  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 587 aa  1170    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844774 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2222  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 487 aa  160  5e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.225964  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3452  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 490 aa  146  9e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  29.61 
 
 		 592 aa  128  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0605  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 478 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0493161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0633  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 478 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.31678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 469 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.33 
 
 		 486 aa  121  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 425 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0534  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 405 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.132719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 405 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.103033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1841  histidine kinase  29.37 
 
 		 430 aa  117  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.033812  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3501  histidine kinase  30.58 
 
 		 469 aa  117  6e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 885 aa  117  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6209  histidine kinase  36.24 
 
 		 343 aa  117  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13796  two component sensor kinase  35.04 
 
 		 506 aa  115  3e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0887286 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.56 
 
 		 1431 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0372  histidine kinase  35.15 
 
 		 432 aa  113  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.623288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  35.11 
 
 		 363 aa  112  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  31.99 
 
 		 478 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0991  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 478 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000946283  decreased coverage  0.000107612 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 610 aa  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  32.3 
 
 		 448 aa  110  6e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 524 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  26.3 
 
 		 461 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 546 aa  110  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 464 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2149  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 		 680 aa  110  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 406 aa  110  8.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3940  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 532 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.115086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3925  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 532 aa  110  9.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.665584  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  32.89 
 
 		 466 aa  109  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 587 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 775 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3999  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  31.05 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3341  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.049327 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2823  histidine kinase  35.11 
 
 		 501 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  29.46 
 
 		 423 aa  109  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 631 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 587 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  32.56 
 
 		 356 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 464 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 775 aa  108  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18370  signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 389 aa  108  3e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0050  histidine kinase  32.38 
 
 		 455 aa  108  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0156  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 		 720 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  32.84 
 
 		 857 aa  108  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04930  signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 		 389 aa  107  5e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  30.28 
 
 		 448 aa  107  5e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 462 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 465 aa  107  6e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  29.91 
 
 		 465 aa  107  7e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1027  histidine kinase  32.39 
 
 		 477 aa  107  8e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0392  histidine kinase  33.46 
 
 		 449 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 453 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4316  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 485 aa  106  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.500539 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  34.98 
 
 		 505 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  31.09 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  28.57 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 596 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  31.92 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0039  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  31.7 
 
 		 774 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 		 452 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0031  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2855  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 712 aa  105  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  34.98 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  34.98 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0393  histidine kinase  34.31 
 
 		 1200 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.564913 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 		 455 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3215  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 477 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 401 aa  105  3e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  34.98 
 
 		 523 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  34.53 
 
 		 505 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  32.23 
 
 		 483 aa  104  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  33.17 
 
 		 449 aa  104  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3037  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 509 aa  104  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  31.39 
 
 		 771 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  35.62 
 
 		 476 aa  104  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.9 
 
 		 447 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5808  sensor histidine kinase  32.26 
 
 		 1299 aa  103  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.284316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 1145 aa  103  6e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  30.99 
 
 		 1152 aa  103  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 482 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 478 aa  103  7e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 772 aa  103  7e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0290  histidine kinase  32.72 
 
 		 333 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24130  signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 		 362 aa  103  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0242619  decreased coverage  0.00839844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1888  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.42 
 
 		 482 aa  103  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.444129  normal  0.382824 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3707  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 		 482 aa  103  9e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2982  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 608 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2455  ATP-binding region ATPase domain protein  28.45 
 
 		 438 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0530823  normal  0.690452 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 		 1137 aa  103  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>