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for query gene PICST_29969 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_29969  multidrug-resistance type transporter  100 
 
 		 497 aa  996    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.83115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30815  MFS family transporter multidrug-resistance type transporter  66.32 
 
 		 490 aa  684    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.179755  normal  0.31113 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09370  MFS transporter of unkown specificity (AFU_orthologue; AFUA_5G09940)  43.45 
 
 		 608 aa  391  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0140992 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41453  multidrug-resistance type transporter aminotriazole resistance  38.16 
 
 		 473 aa  326  5e-88  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.141492  normal  0.652561 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02625  MFS transporter of unkown specificity (AFU_orthologue; AFUA_1G11350)  36.74 
 
 		 520 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03220  MFS transporter, putative  37.58 
 
 		 563 aa  285  9e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.118542  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00450  MFS transporter, putative  36.04 
 
 		 540 aa  274  3e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.454016  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00390  multidrug efflux pump, putative  34.19 
 
 		 654 aa  251  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01724  conserved hypothetical protein  30.94 
 
 		 576 aa  218  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03301  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13820)  27.94 
 
 		 516 aa  169  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.286718 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02368  conserved hypothetical protein  29.61 
 
 		 520 aa  162  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.291195 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00601  conserved hypothetical protein  27.91 
 
 		 639 aa  161  2e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02040  efflux protein, putative  25.88 
 
 		 618 aa  133  6.999999999999999e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.239478  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.29 
 
 		 757 aa  113  7.000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.35 
 
 		 505 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00430  conserved hypothetical protein  21.01 
 
 		 562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.972638  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.32 
 
 		 509 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  30.19 
 
 		 733 aa  109  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.53 
 
 		 487 aa  109  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.717354 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10862  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06760)  23.88 
 
 		 518 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  26.26 
 
 		 471 aa  101  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.78 
 
 		 498 aa  101  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  28.07 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.68 
 
 		 534 aa  99.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  27.34 
 
 		 498 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0326  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.11 
 
 		 539 aa  99  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2306  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 581 aa  99  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.434674 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01145  conserved hypothetical protein  24.14 
 
 		 533 aa  97.1  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0445275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0958  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.93 
 
 		 511 aa  97.1  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.026733  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.91 
 
 		 487 aa  96.7  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4079  major facilitator transporter  24.58 
 
 		 470 aa  96.7  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0276069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  21.67 
 
 		 527 aa  94.7  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.49 
 
 		 514 aa  95.1  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0882  major facilitator transporter  30.3 
 
 		 462 aa  94  6e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000000105455  hitchhiker  0.00000000451696 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1077  major facilitator superfamily permease  25.27 
 
 		 444 aa  93.2  9e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  26 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 494 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1664  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.06 
 
 		 486 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.47 
 
 		 490 aa  92.4  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0642  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.06 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.06 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.129179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1688  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.06 
 
 		 486 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0523  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.06 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.42 
 
 		 788 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1637  EmrB/QacA family drug resistance transporter  22.06 
 
 		 486 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.56 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  26.72 
 
 		 489 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.03 
 
 		 546 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.75 
 
 		 489 aa  91.3  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1554  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.87 
 
 		 502 aa  91.7  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.028716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.89 
 
 		 609 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0693  major facilitator superfamily MFS_1  24.88 
 
 		 472 aa  90.5  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.447559 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2293  major facilitator superfamily MFS_1  25.07 
 
 		 513 aa  90.5  7e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  26.26 
 
 		 491 aa  90.5  7e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1098  major facilitator superfamily MFS_1  26.48 
 
 		 591 aa  90.1  8e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.948323  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  23.03 
 
 		 481 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7524  major facilitator superfamily MFS_1  24.27 
 
 		 503 aa  89.4  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  22.86 
 
 		 487 aa  89.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4056  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.8 
 
 		 509 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.010273  normal  0.647251 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  22.3 
 
 		 511 aa  89  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3271  major facilitator superfamily MFS_1  27.41 
 
 		 570 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.469409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1211  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 474 aa  89  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000173794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  26.55 
 
 		 579 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.4 
 
 		 528 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2480  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.56 
 
 		 504 aa  87  6e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1157  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.14 
 
 		 504 aa  87.4  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153598  normal  0.545064 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5634  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 504 aa  87.4  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.327669 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4024  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.8 
 
 		 509 aa  87  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.179138  normal  0.623334 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.5 
 
 		 519 aa  87  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306727  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02100  expressed protein  24.72 
 
 		 529 aa  86.7  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.320661  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0051  major facilitator superfamily MFS_1  27.56 
 
 		 573 aa  86.7  9e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4512  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.91 
 
 		 504 aa  86.7  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3298  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.74 
 
 		 538 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1052  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.6 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.923754  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  23.02 
 
 		 511 aa  86.3  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2050  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.09 
 
 		 516 aa  85.9  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.851205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3147  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.3 
 
 		 541 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4898  putative transport protein  23.9 
 
 		 489 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00331224  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4474  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.44 
 
 		 627 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.137997  normal  0.105025 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.57 
 
 		 509 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3702  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 509 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2756  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.18 
 
 		 682 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3970  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.76 
 
 		 646 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_4666  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.69 
 
 		 509 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481677  normal  0.435005 
 
 
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NC_008705  Mkms_2800  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.18 
 
 		 682 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375758  normal  0.713659 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4044  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.76 
 
 		 646 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.53 
 
 		 534 aa  84.7  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
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NC_009077  Mjls_2786  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.18 
 
 		 682 aa  84.7  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.54 
 
 		 539 aa  84.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_3984  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.76 
 
 		 646 aa  84.7  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.086459  normal  0.10455 
 
 
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NC_006684  CNB02170  conserved hypothetical protein  26.1 
 
 		 513 aa  84  0.000000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.922145  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_3647  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.06 
 
 		 486 aa  83.6  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.04243 
 
 
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NC_013739  Cwoe_3291  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.65 
 
 		 666 aa  83.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47407  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.77 
 
 		 532 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
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NC_006680  CNK02980  hypothetical protein  23.42 
 
 		 598 aa  83.6  0.000000000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.157268  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_14840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.6 
 
 		 512 aa  83.6  0.000000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.038471 
 
 
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NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.87 
 
 		 512 aa  83.6  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
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NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.4 
 
 		 493 aa  83.6  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  27.1 
 
 		 485 aa  82.8  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.116628 
 
 
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NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.83 
 
 		 579 aa  83.2  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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