More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB00430 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006684  CNB00430  conserved hypothetical protein  100 
 
 
562 aa  1131    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.972638  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02040  efflux protein, putative  31.43 
 
 
618 aa  286  5.999999999999999e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.239478  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01724  conserved hypothetical protein  26.23 
 
 
576 aa  167  5.9999999999999996e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10862  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06760)  26.22 
 
 
518 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00390  multidrug efflux pump, putative  24.56 
 
 
654 aa  151  3e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03301  MFS multidrug transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13820)  26.67 
 
 
516 aa  147  7.0000000000000006e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.286718 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03220  MFS transporter, putative  23.93 
 
 
563 aa  144  5e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.118542  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00450  MFS transporter, putative  25.52 
 
 
540 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.454016  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_41453  multidrug-resistance type transporter aminotriazole resistance  26.34 
 
 
473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.141492  normal  0.652561 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30815  MFS family transporter multidrug-resistance type transporter  22.95 
 
 
490 aa  130  9.000000000000001e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.179755  normal  0.31113 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09370  MFS transporter of unkown specificity (AFU_orthologue; AFUA_5G09940)  24.31 
 
 
608 aa  126  1e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0140992 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  27.87 
 
 
478 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02368  conserved hypothetical protein  23.22 
 
 
520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.291195 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02625  MFS transporter of unkown specificity (AFU_orthologue; AFUA_1G11350)  22.53 
 
 
520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00601  conserved hypothetical protein  25 
 
 
639 aa  113  7.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01145  conserved hypothetical protein  27.09 
 
 
533 aa  113  8.000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0445275 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29969  multidrug-resistance type transporter  21.01 
 
 
497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.83115  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  26.75 
 
 
471 aa  108  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02980  hypothetical protein  24.02 
 
 
598 aa  106  9e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.157268  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.57 
 
 
763 aa  104  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.12 
 
 
498 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.86 
 
 
509 aa  103  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02100  expressed protein  24.07 
 
 
529 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.320661  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04630  efflux protein EncT, putative  23.47 
 
 
533 aa  100  6e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.794342  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1276  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 
483 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02170  conserved hypothetical protein  23.04 
 
 
513 aa  100  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.922145  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2897  major facilitator superfamily drug efflux transporter  25.54 
 
 
525 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.430026  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  25.84 
 
 
498 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.65 
 
 
528 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01170  hypothetical protein  22.69 
 
 
554 aa  97.1  7e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.84 
 
 
532 aa  97.1  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.42 
 
 
527 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.79 
 
 
487 aa  95.9  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  25.18 
 
 
494 aa  94.7  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  28.38 
 
 
492 aa  94.7  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.37 
 
 
757 aa  93.6  8e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  23.44 
 
 
788 aa  93.6  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  25.15 
 
 
733 aa  93.6  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7839  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.89 
 
 
505 aa  93.2  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0757914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0336  transporter protein  27.05 
 
 
489 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0230531  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.89 
 
 
592 aa  92.4  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0772  major facilitator superfamily transporter  25.87 
 
 
464 aa  92  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 
478 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 
478 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  24.63 
 
 
514 aa  91.3  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.82 
 
 
480 aa  91.3  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  25.28 
 
 
478 aa  90.9  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1718  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 
500 aa  90.5  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.28 
 
 
478 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  25 
 
 
478 aa  90.5  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2172  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.03 
 
 
524 aa  90.1  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.632286  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2451  transporter protein  25.62 
 
 
472 aa  89.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.507711 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5808  putative transmembrane protein  27.41 
 
 
483 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.44132 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5131  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 
487 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.22804  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25 
 
 
479 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.72 
 
 
479 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25.63 
 
 
476 aa  87.4  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  25.68 
 
 
469 aa  87  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4526  efflux transporter  28.33 
 
 
303 aa  86.7  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.344651  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  24.44 
 
 
528 aa  86.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  23.54 
 
 
481 aa  85.9  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.29 
 
 
519 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1265  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 
524 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.71 
 
 
545 aa  84.7  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4807  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 
466 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000796608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4580  major facilitator superfamily MFS_1  26.77 
 
 
500 aa  84.7  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1766  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.06 
 
 
479 aa  84.3  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.239731  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1712  Sugar phosphate permease-like protein  24.56 
 
 
530 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0412  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.11 
 
 
499 aa  84.3  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.758903  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2315  major facilitator superfamily MFS_1  27.88 
 
 
523 aa  84.3  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8779  putative transport protein  24.34 
 
 
481 aa  84.3  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2307  major facilitator superfamily transporter  26.78 
 
 
508 aa  84.3  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.018174  normal  0.0567456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0892  major facilitator superfamily MFS_1  24.83 
 
 
508 aa  84  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2136  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
488 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  25.09 
 
 
457 aa  83.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3227  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.51 
 
 
501 aa  83.2  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.07 
 
 
487 aa  82  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5749  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.3 
 
 
607 aa  82  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2609  major facilitator transporter  26.85 
 
 
516 aa  82  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.151615 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.62 
 
 
520 aa  82.4  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11276  drug-transport integral membrane protein  26.04 
 
 
579 aa  82.4  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.201451 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1328  multidrug resistance protein B  25.07 
 
 
511 aa  82.8  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.307872  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1270  major facilitator transporter  28.51 
 
 
494 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2493  major facilitator superfamily MFS_1  25.86 
 
 
517 aa  82.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000001804  hitchhiker  0.00137453 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3359  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.37 
 
 
1112 aa  81.6  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0181255 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.17 
 
 
532 aa  81.3  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4340  major facilitator transporter  25 
 
 
480 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.199167  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23710  arabinose efflux permease family protein  24.82 
 
 
469 aa  81.3  0.00000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.876933  normal  0.277036 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3277  major facilitator transporter  27.9 
 
 
513 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0884911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2173  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 
477 aa  80.9  0.00000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3744  major facilitator superfamily MFS_1  23.83 
 
 
484 aa  80.9  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4088  major facilitator superfamily MFS_1  26.68 
 
 
501 aa  80.9  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.246435 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.76 
 
 
510 aa  80.1  0.00000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0468025  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3129  major facilitator transporter  28.04 
 
 
514 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.91445  decreased coverage  0.000257265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4875  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.48 
 
 
579 aa  79.7  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2493  major facilitator superfamily MFS_1  28.05 
 
 
484 aa  79.7  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.15789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 
518 aa  79.7  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1498  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  26.82 
 
 
481 aa  79  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.270463  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0877  major facilitator superfamily permease  21.87 
 
 
496 aa  79.3  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.192576  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3582  major facilitator transporter  30.28 
 
 
510 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.520992  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>